158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0854 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  43.82 
 
 		 3506 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  46.57 
 
 		 2396 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  46.49 
 
 		 2371 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  47.23 
 
 		 2346 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 3629 aa  6400    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  46.79 
 
 		 2366 aa  790    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  47.33 
 
 		 2365 aa  797    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  34.87 
 
 		 1881 aa  590  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  44.47 
 
 		 4238 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  45.15 
 
 		 3954 aa  572  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.86 
 
 		 2711 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  44.69 
 
 		 4238 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.75 
 
 		 1530 aa  439  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.73 
 
 		 2906 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  44.89 
 
 		 3822 aa  421  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  35.82 
 
 		 1119 aa  389  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  37.98 
 
 		 1971 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.96 
 
 		 3322 aa  354  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.55 
 
 		 1508 aa  349  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.89 
 
 		 1532 aa  301  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.6 
 
 		 1848 aa  267  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  29.26 
 
 		 1550 aa  261  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.56 
 
 		 1081 aa  251  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.19 
 
 		 1227 aa  243  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  36.61 
 
 		 2578 aa  240  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  30.85 
 
 		 2407 aa  236  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.37 
 
 		 1782 aa  228  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  43.06 
 
 		 1459 aa  220  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.97 
 
 		 1519 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  42.65 
 
 		 1458 aa  201  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.39 
 
 		 1029 aa  198  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.47 
 
 		 1285 aa  195  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.61 
 
 		 1882 aa  190  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.05 
 
 		 919 aa  187  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  29.57 
 
 		 990 aa  186  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39.06 
 
 		 3391 aa  186  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  32.53 
 
 		 986 aa  182  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.6 
 
 		 1011 aa  182  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 2003 aa  177  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  31.07 
 
 		 2057 aa  167  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  34.49 
 
 		 1741 aa  159  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 		 3415 aa  154  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.48 
 
 		 3420 aa  154  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.07 
 
 		 1055 aa  151  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.53 
 
 		 1113 aa  150  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  34.33 
 
 		 1593 aa  149  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.12 
 
 		 972 aa  149  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  31.61 
 
 		 1038 aa  148  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.21 
 
 		 1322 aa  146  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.18 
 
 		 1125 aa  140  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  30.95 
 
 		 1001 aa  140  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.51 
 
 		 1001 aa  140  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  29.74 
 
 		 1028 aa  138  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  38.44 
 
 		 861 aa  129  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.43 
 
 		 991 aa  127  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  34.99 
 
 		 1172 aa  127  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.01 
 
 		 1333 aa  127  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  38.85 
 
 		 415 aa  126  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  34.6 
 
 		 1111 aa  123  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  29.37 
 
 		 995 aa  117  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  28.18 
 
 		 983 aa  116  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  27.87 
 
 		 2642 aa  116  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  39.08 
 
 		 950 aa  113  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  28.96 
 
 		 1130 aa  112  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1300 aa  111  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  34.1 
 
 		 1130 aa  111  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  41.6 
 
 		 2363 aa  110  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.87 
 
 		 1769 aa  107  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  37.07 
 
 		 1861 aa  107  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  27.79 
 
 		 1016 aa  107  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.02 
 
 		 3089 aa  107  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.16 
 
 		 1694 aa  106  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28.9 
 
 		 1004 aa  106  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 		 1056 aa  105  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.96 
 
 		 1489 aa  105  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  31.22 
 
 		 852 aa  104  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  28.49 
 
 		 1164 aa  104  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  30.18 
 
 		 1011 aa  103  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.19 
 
 		 677 aa  102  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  28.78 
 
 		 985 aa  100  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.82 
 
 		 1033 aa  99.8  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.57 
 
 		 994 aa  99  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.47 
 
 		 2926 aa  96.3  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  39.06 
 
 		 1806 aa  94.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  39.68 
 
 		 1571 aa  94.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  36.59 
 
 		 1632 aa  94.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.37 
 
 		 1357 aa  89.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  32.96 
 
 		 1108 aa  85.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  37.12 
 
 		 1099 aa  82.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.87 
 
 		 1180 aa  77  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  50.5 
 
 		 995 aa  75.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  28.57 
 
 		 650 aa  72.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 		 994 aa  71.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.18 
 
 		 1953 aa  70.5  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1165 aa  70.1  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  30.35 
 
 		 1165 aa  70.1  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.51 
 
 		 3152 aa  69.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1325 aa  68.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.56 
 
 		 3015 aa  66.6  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  40.31 
 
 		 987 aa  65.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>