16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0815 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  100 
 
 
417 aa  853    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  33.8 
 
 
1027 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  40.12 
 
 
390 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  30.83 
 
 
528 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  30.43 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4908  hypothetical protein  30 
 
 
535 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  35.4 
 
 
2062 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  30.3 
 
 
685 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  28.8 
 
 
689 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  27.49 
 
 
602 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  26.36 
 
 
630 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  27.02 
 
 
599 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  27.13 
 
 
596 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4897  hypothetical protein  25.49 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02501  hypothetical protein  80.77 
 
 
211 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  30.15 
 
 
560 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>