61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0798 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  100 
 
 
213 aa  397  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  50.49 
 
 
234 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  51.61 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  53.45 
 
 
213 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  48.76 
 
 
203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  45.77 
 
 
227 aa  160  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  48.68 
 
 
209 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  49.03 
 
 
244 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  53.04 
 
 
206 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  53.59 
 
 
214 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  48.91 
 
 
295 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  51.52 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  50.54 
 
 
220 aa  147  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  48.24 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  43.9 
 
 
234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  49.16 
 
 
228 aa  144  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  43.84 
 
 
287 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  43.06 
 
 
249 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  51.58 
 
 
209 aa  143  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  54.27 
 
 
226 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  54.27 
 
 
226 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  54.27 
 
 
226 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  50.56 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  47.83 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  48.96 
 
 
224 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  44.19 
 
 
219 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  49.19 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  55.06 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  55.06 
 
 
218 aa  131  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  48.15 
 
 
228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  38.5 
 
 
225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  45.45 
 
 
211 aa  121  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  37.93 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  36.87 
 
 
218 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  33.16 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  32.12 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  31.52 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  32.48 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  28.96 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  32.48 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  33.12 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  33.12 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  33.12 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  33.12 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  28.9 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  30.86 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  23.91 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  23.91 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0727  hypothetical protein  25.14 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000106569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  25.82 
 
 
306 aa  52.8  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  28.38 
 
 
243 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2378  protein of unknown function DUF161  27.32 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.793983  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  23.72 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  23.72 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  26.47 
 
 
221 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  23.26 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  22.17 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0973  hypothetical protein  25.79 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0948172  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0871  hypothetical protein  23.81 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0394  hypothetical protein  22.56 
 
 
212 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.625345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>