More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0758 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
99 aa  197  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04519  50S ribosomal protein L23  92.93 
 
 
99 aa  161  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  75.51 
 
 
100 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  74.49 
 
 
100 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  61.54 
 
 
97 aa  113  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  57.61 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000230523  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 
100 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  51.52 
 
 
100 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 
100 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
100 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
98 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 
113 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
100 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
100 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 
111 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3336  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
101 aa  95.9  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000112822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
100 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
97 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
97 aa  94  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  48.48 
 
 
100 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000423409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
100 aa  94  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1852  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
95 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000651916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 
98 aa  93.6  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000576147  unclonable  0.00000000000382148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
100 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0339  50S ribosomal protein L23  50.54 
 
 
95 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
99 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
99 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
99 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
99 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0061  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
101 aa  92  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000105028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0321  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.11411e-18  hitchhiker  0.000000647477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.42 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  48.42 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  47.42 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 
101 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  49.46 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000144621  decreased coverage  0.0000412321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  46.46 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3907  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.104737  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
100 aa  89.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  47.47 
 
 
101 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
100 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000395002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  47.47 
 
 
101 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  47.47 
 
 
101 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  47.47 
 
 
100 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 
98 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  45.36 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
100 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 
101 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3997  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000137329 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0393  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000842978  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0281  50S ribosomal protein L23  44.33 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926616  hitchhiker  0.00000149946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  48.94 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
102 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3774  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3802  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00374922  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3295  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000040814  hitchhiker  0.0000223362 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 
98 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0329  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000104942  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3167  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145787  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>