226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0720 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  69.18 
 
 		 568 aa  774    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 570 aa  1131    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 		 700 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 1085 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 618 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 3560 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  36.83 
 
 		 647 aa  306  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 3035 aa  302  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  42.33 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 4489 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  39.49 
 
 		 569 aa  286  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 732 aa  283  6.000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 1094 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 611 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  36.83 
 
 		 459 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 		 672 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  40.56 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 		 654 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 740 aa  257  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  34.48 
 
 		 560 aa  253  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 761 aa  251  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  33.39 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 616 aa  248  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 706 aa  247  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.04 
 
 		 816 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 667 aa  240  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 750 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 660 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 909 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 808 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  41.61 
 
 		 295 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  35.5 
 
 		 632 aa  223  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 750 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 739 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  40.17 
 
 		 590 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  35.16 
 
 		 637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  32.14 
 
 		 566 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  32.75 
 
 		 624 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  29.84 
 
 		 657 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  29.91 
 
 		 657 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.8 
 
 		 632 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  33.06 
 
 		 395 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  36.34 
 
 		 588 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  33.16 
 
 		 633 aa  186  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.64 
 
 		 582 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.07 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.18 
 
 		 780 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 780 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 708 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  27.39 
 
 		 719 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.9 
 
 		 630 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 		 598 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 779 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 633 aa  166  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 776 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 821 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 		 1106 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 619 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 776 aa  163  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 821 aa  163  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 789 aa  163  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 776 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 776 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 776 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 626 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 968 aa  160  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 		 589 aa  159  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 739 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 739 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.82 
 
 		 585 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.28 
 
 		 1221 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 833 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 833 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 789 aa  153  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 1714 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.74 
 
 		 790 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 738 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.1 
 
 		 596 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  27.85 
 
 		 745 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1106 aa  150  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 718 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  26.46 
 
 		 781 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 		 790 aa  147  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 727 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 734 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 828 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.34 
 
 		 921 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 828 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  26.03 
 
 		 747 aa  143  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  30.58 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 828 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  25.41 
 
 		 740 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 1143 aa  140  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  30.18 
 
 		 731 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.41 
 
 		 699 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 822 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>