More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0712 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  61.82 
 
 
560 aa  666    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
579 aa  1152    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  68.74 
 
 
454 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  56.21 
 
 
641 aa  452  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.61 
 
 
651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.21 
 
 
617 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0379  serine metalloprotease precursor  56.57 
 
 
502 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.53 
 
 
627 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1101  serine metalloprotease  56 
 
 
500 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0573282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2709  serine metalloprotease  56 
 
 
497 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  56 
 
 
497 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0340  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.55 
 
 
624 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.67 
 
 
939 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1582  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.71 
 
 
501 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03059  protease  41.94 
 
 
620 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3184  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.2 
 
 
1687 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1078  serine metalloprotease MrpA  47.47 
 
 
539 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.673556  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1248  serine metalloprotease MrpA  47.47 
 
 
539 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0493  serine metalloprotease MrpA  47.47 
 
 
539 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179342  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0221  serine metalloprotease MrpA  47.47 
 
 
539 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1343  putative serine metalloprotease  47.47 
 
 
563 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2585  peptidase  47.47 
 
 
563 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1417  serine metalloprotease MrpA  47.73 
 
 
560 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1426  putative serine metalloprotease  47.47 
 
 
563 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1283  peptidase MprA  46.6 
 
 
550 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.1 
 
 
555 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.923293  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4080  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.42 
 
 
549 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5741  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.98 
 
 
552 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0530598  normal  0.287024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.98 
 
 
552 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4563  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.98 
 
 
552 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3992  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.36 
 
 
555 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355487  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1117  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  40.67 
 
 
724 aa  290  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0579806  normal  0.63577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.09 
 
 
771 aa  279  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.76 
 
 
636 aa  279  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.382458 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.86 
 
 
721 aa  272  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.98 
 
 
498 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2654  serine protease protein  36.91 
 
 
679 aa  266  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2484  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.65 
 
 
547 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2890  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.43 
 
 
547 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2704  serine protease  37.53 
 
 
564 aa  264  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0794852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.86 
 
 
754 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234127  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.95 
 
 
693 aa  263  4.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000805587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2653  putative extracellular protease signal peptide protein  41.04 
 
 
543 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1032  peptidase MprA  40.85 
 
 
555 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.49 
 
 
648 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0261  hypothetical protein  37.77 
 
 
688 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.194393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2485  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.79 
 
 
650 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.56 
 
 
520 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 
629 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.89 
 
 
629 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.68 
 
 
629 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.68 
 
 
629 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  35.36 
 
 
489 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37 
 
 
587 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.27 
 
 
630 aa  223  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.91 
 
 
882 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  35.86 
 
 
534 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0996  peptidase MprA  38.46 
 
 
540 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.526274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5741  serine protease, subtilase family  38.95 
 
 
564 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  34.47 
 
 
533 aa  213  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 
589 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.44 
 
 
589 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.25 
 
 
868 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.94 
 
 
601 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.85 
 
 
628 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.01 
 
 
852 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.1 
 
 
583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.31 
 
 
399 aa  200  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.18 
 
 
615 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.29 
 
 
615 aa  194  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.69 
 
 
557 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.89 
 
 
595 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  33.68 
 
 
535 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.99 
 
 
612 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1996  hypothetical protein  33.4 
 
 
562 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.2 
 
 
797 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.75 
 
 
401 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2001  hypothetical protein  33.06 
 
 
562 aa  176  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.27 
 
 
639 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.38 
 
 
692 aa  170  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.55 
 
 
1272 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0457  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.39 
 
 
394 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.29 
 
 
415 aa  167  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.01 
 
 
653 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  34.25 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  33.74 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.77 
 
 
397 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  33.95 
 
 
397 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  33.5 
 
 
397 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  33.95 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  33.95 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  33.95 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  33.5 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  33.95 
 
 
397 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  33 
 
 
397 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02673  extracellular protease  62.5 
 
 
170 aa  161  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2796  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.11 
 
 
856 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.55 
 
 
638 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.42 
 
 
577 aa  157  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.71 
 
 
807 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>