267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0664 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 163 aa  338  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  61.59 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  60.98 
 
 		 164 aa  202  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  60.98 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  51.83 
 
 		 175 aa  168  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  167  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 163 aa  166  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  51.61 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  46.01 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  49.39 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  49.36 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  48.19 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  47.27 
 
 		 167 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  157  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  44.17 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  46.63 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  55.32 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 171 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 174 aa  153  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  49.37 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  47.67 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  48.41 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  48.77 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 169 aa  150  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 		 195 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  49.08 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.12 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  45.34 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 		 170 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  48.47 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  47.83 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 196 aa  140  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  47.2 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 196 aa  140  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  42.24 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  47.2 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  47.53 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.3 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 209 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 		 219 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  48.98 
 
 		 168 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>