41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0654 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
233 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  63.86 
 
 
167 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  47.4 
 
 
257 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  44.85 
 
 
230 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  44.56 
 
 
268 aa  174  1e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  44.68 
 
 
248 aa  173  2e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  43.6 
 
 
197 aa  151  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  39.36 
 
 
238 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  37.89 
 
 
217 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  36.21 
 
 
280 aa  138  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  38.83 
 
 
216 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  121  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  31.61 
 
 
240 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  29.28 
 
 
871 aa  109  4e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  31.38 
 
 
509 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  29.74 
 
 
207 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  34.93 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  28.08 
 
 
243 aa  95.1  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  30.39 
 
 
255 aa  77.4  2e-13  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  31.35 
 
 
235 aa  67  3e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.14 
 
 
261 aa  65.9  6e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2912  1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase  28.73 
 
 
268 aa  60.1  3e-08  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1544  lipolytic protein G-D-S-L family  26.75 
 
 
260 aa  59.3  6e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158238  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  26.63 
 
 
204 aa  58.5  9e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  63.41 
 
 
48 aa  58.2  1e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  26.29 
 
 
424 aa  58.2  1e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0305  hypothetical protein  26.86 
 
 
244 aa  56.2  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1166  lipolytic protein G-D-S-L family  27.84 
 
 
447 aa  51.6  1e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  25.94 
 
 
249 aa  50.4  3e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1546  lipolytic protein G-D-S-L family  27.59 
 
 
262 aa  48.5  9e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.563827  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  27.01 
 
 
383 aa  48.5  9e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  28.85 
 
 
479 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  31.21 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3977  lipolytic protein G-D-S-L family  27.51 
 
 
593 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410599  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2269  GDSL family lipase  26.28 
 
 
235 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0100927 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1045  hypothetical protein  22.08 
 
 
152 aa  45.1  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.517401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  23.29 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  23.42 
 
 
274 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  22.37 
 
 
1072 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3728  lipolytic protein G-D-S-L family  23.66 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0881256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  21.13 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>