More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0610 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  100 
 
 
318 aa  644    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  67.3 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  61.06 
 
 
369 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  60.4 
 
 
319 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  37.54 
 
 
310 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  42.51 
 
 
315 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  43.51 
 
 
307 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  41.98 
 
 
305 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  41.27 
 
 
307 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  45.35 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  36.15 
 
 
305 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.87 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  42.74 
 
 
321 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  36.66 
 
 
310 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  40.71 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  37.85 
 
 
299 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  42.92 
 
 
320 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  39.33 
 
 
299 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  39.92 
 
 
316 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  41.67 
 
 
340 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  34.82 
 
 
318 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  37.85 
 
 
299 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  42.31 
 
 
321 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  37.85 
 
 
299 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  38.91 
 
 
299 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  39.33 
 
 
299 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  39.33 
 
 
299 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  39.33 
 
 
299 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  39.33 
 
 
299 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  37.85 
 
 
299 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.11 
 
 
288 aa  175  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  38.49 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  39.52 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  38.91 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  40.6 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  36.48 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  38.87 
 
 
299 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  38.49 
 
 
299 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  40.69 
 
 
327 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  35.5 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  38.86 
 
 
299 aa  165  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  36.84 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  35.42 
 
 
299 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  36.82 
 
 
332 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  52.23 
 
 
387 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  35.59 
 
 
288 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  43.75 
 
 
384 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  50.29 
 
 
402 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.29 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  44.58 
 
 
332 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  44.58 
 
 
394 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.78 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.5 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  52.67 
 
 
455 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32.39 
 
 
313 aa  135  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.62 
 
 
301 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  50 
 
 
298 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.37 
 
 
454 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  52.24 
 
 
391 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  51.15 
 
 
459 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.27 
 
 
455 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.94 
 
 
456 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.11 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  35.59 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  33.09 
 
 
305 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.88 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  50.75 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  49.62 
 
 
457 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  33.21 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  50 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  33.21 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  50.76 
 
 
450 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  43.59 
 
 
445 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50.38 
 
 
453 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.38 
 
 
430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  50.39 
 
 
442 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  50 
 
 
414 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  40.11 
 
 
413 aa  125  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  45.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  39.08 
 
 
439 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  50 
 
 
541 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.84 
 
 
300 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  35.74 
 
 
440 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  48.76 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.57 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  45 
 
 
442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  54.31 
 
 
243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  27.36 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  41.04 
 
 
375 aa  119  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.51 
 
 
446 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  45.67 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  48.36 
 
 
656 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  44.7 
 
 
459 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.53 
 
 
229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  52.54 
 
 
754 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  48.28 
 
 
373 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  29.08 
 
 
302 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  45.38 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.15 
 
 
411 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  42.96 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>