288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0563 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5935  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.77 
 
 		 1040 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0563  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  100 
 
 		 861 aa  1747    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0063  outer membrane usher protein precursor  53.06 
 
 		 901 aa  925    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0335545  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0052  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  53.06 
 
 		 901 aa  923    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2970  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  42.99 
 
 		 880 aa  652    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1151  putative fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.5 
 
 		 866 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4252  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.79 
 
 		 850 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22475 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4959  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.55 
 
 		 867 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4024  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.4 
 
 		 866 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6927  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.67 
 
 		 886 aa  640    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1817  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  44.3 
 
 		 851 aa  719    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513641 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0574  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.28 
 
 		 852 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6669  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.51 
 
 		 856 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0838  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.45 
 
 		 852 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1696  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  43.02 
 
 		 872 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1600  outer membrane usher protein  41.79 
 
 		 913 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.68483  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0152  fimbrial usher protein  41.79 
 
 		 914 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0128  fimbrial usher protein  41.79 
 
 		 914 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5938  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.24 
 
 		 963 aa  600  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3032  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.61 
 
 		 930 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0117  outer membrane usher protein  40.89 
 
 		 939 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6638  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  41.29 
 
 		 884 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00144126  decreased coverage  0.000000000434399 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1788  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.38 
 
 		 870 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0202884  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1677  fimbrial usher protein  38.23 
 
 		 870 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1016  usher CupB3  41.54 
 
 		 842 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3021  usher  41.19 
 
 		 868 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37030  usher  41.97 
 
 		 872 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11080  usher CupB3  40.32 
 
 		 844 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1534  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.57 
 
 		 880 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.155889  normal  0.781332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04186  outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis  36.98 
 
 		 878 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04148  hypothetical protein  36.98 
 
 		 878 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3680  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.86 
 
 		 878 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4543  outer membrane usher protein fimD  36.86 
 
 		 863 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0863199  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4844  outer membrane usher protein fimD  36.86 
 
 		 856 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5823  outer membrane usher protein fimD  36.87 
 
 		 878 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.941906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51450  usher CupC3  38.57 
 
 		 839 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.390609  hitchhiker  0.000267992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.29 
 
 		 883 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.318083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0169  fimbrial usher protein  36.29 
 
 		 883 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1071  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.54 
 
 		 877 aa  505  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2281  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.22 
 
 		 876 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2831  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.93 
 
 		 887 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4405  usher CupC3  37.87 
 
 		 839 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0501  fimbrial usher protein  35.82 
 
 		 875 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316711  decreased coverage  0.00141222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0209  putative outer membrane usher protein  34.81 
 
 		 865 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2235  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.36 
 
 		 819 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0323635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3755  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.6 
 
 		 851 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0369  outer membrane fimbrial usher protein  37.72 
 
 		 853 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0763  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  38.98 
 
 		 852 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.794501  normal  0.0266103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0431  outer membrane fimbrial usher protein  37.72 
 
 		 853 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000247284 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0371  outer membrane fimbrial usher protein  37.72 
 
 		 853 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0391  outer membrane fimbrial usher protein  37.49 
 
 		 853 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0860729  normal  0.0225647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1133  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.81 
 
 		 844 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.127861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0378  outer membrane fimbrial usher protein  37.72 
 
 		 853 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3520  putative outer membrane usher protein  36.18 
 
 		 866 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.315338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2108  fimbrial usher protein  35.53 
 
 		 854 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164187  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3463  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.01 
 
 		 865 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.93384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2274  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.53 
 
 		 863 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2165  fimbrial usher protein  35.53 
 
 		 854 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.795647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1665  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.78 
 
 		 929 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00137  hypothetical protein  35.28 
 
 		 861 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.206495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00138  predicted outer membrane usher protein  35.28 
 
 		 866 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.242509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0599  fimbrial usher protein  36.14 
 
 		 870 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0484781 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1666  fimbrial usher family protein  35.25 
 
 		 871 aa  482  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3292  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.98 
 
 		 835 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249983 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0142  putative outer membrane usher protein  36.05 
 
 		 866 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0236514  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0592  outer membrane usher protein SfmD  35.9 
 
 		 870 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0701442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0591  outer membrane usher protein SfmD  36.02 
 
 		 870 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.053453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0595  outer membrane usher protein SfmD  36.02 
 
 		 870 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.232455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0656  outer membrane usher protein SfmD  35.9 
 
 		 870 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3924  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.99 
 
 		 875 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215778  normal  0.607518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3974  putative outer membrane usher protein  36.53 
 
 		 866 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.183336  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3811  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.99 
 
 		 875 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647139  normal  0.153634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1521  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  32.59 
 
 		 871 aa  475  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.911092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1053  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.26 
 
 		 837 aa  475  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2874  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  36.51 
 
 		 840 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0148  putative outer membrane usher protein  35.41 
 
 		 866 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.234756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1477  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.37 
 
 		 890 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.432789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0832  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  37.03 
 
 		 853 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.646384  normal  0.17108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1365  fimbrial usher protein  34.49 
 
 		 833 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.347917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4155  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.4 
 
 		 836 aa  469  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0168  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  35.61 
 
 		 864 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3044  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  34.84 
 
 		 828 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.120847  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1271  outer membrane usher protein SfmD  36.58 
 
 		 851 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.396185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0150  putative outer membrane usher protein  33.81 
 
 		 866 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0557898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0207  putative outer membrane usher protein  35.39 
 
 		 888 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2179  outer membrane usher protein fimD-like protein  34.21 
 
 		 866 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.932643  normal  0.834799 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1055  outer membrane usher protein fimD  33.92 
 
 		 866 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00944  predicted outer membrane usher protein  33.69 
 
 		 866 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.887822  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0026  outer membrane usher protein FimD  35.9 
 
 		 888 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2703  fimbrial biogenesis outer membrane usher protein  33.69 
 
 		 866 aa  452  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0538339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0024  outer membrane usher protein FimD  35.9 
 
 		 873 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.267854  normal  0.163844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3916  fimbrial usher protein  34.69 
 
 		 842 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.834184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0025  outer membrane usher protein FimD  35.9 
 
 		 888 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.028823  normal  0.118886 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00951  hypothetical protein  33.69 
 
 		 866 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.90606  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2377  outer membrane usher protein fimD homolog  33.8 
 
 		 866 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.108506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3960  outer membrane usher protein FimD  34.69 
 
 		 842 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3851  outer membrane usher protein FimD  35.73 
 
 		 842 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0025  outer membrane usher protein FimD  36.02 
 
 		 888 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0588197  normal  0.0296149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0026  outer membrane usher protein FimD  35.78 
 
 		 888 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0792355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1023  outer membrane usher protein  34.77 
 
 		 850 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>