More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0546 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  62.17 
 
 
585 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  67.02 
 
 
585 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  67.02 
 
 
585 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  80.35 
 
 
575 aa  899    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  100 
 
 
573 aa  1140    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  76.16 
 
 
566 aa  843    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  76.16 
 
 
566 aa  842    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  60.5 
 
 
580 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  59.68 
 
 
563 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  52.58 
 
 
575 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  52.64 
 
 
567 aa  510  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  52.25 
 
 
578 aa  511  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  50.74 
 
 
559 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  50.79 
 
 
578 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  46.98 
 
 
599 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  42.78 
 
 
558 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  46.98 
 
 
599 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  44.74 
 
 
566 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  55.25 
 
 
514 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  46.62 
 
 
599 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.76 
 
 
570 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.21 
 
 
603 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
565 aa  417  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  46.76 
 
 
521 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.39 
 
 
553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.47 
 
 
562 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  44.48 
 
 
575 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.71 
 
 
571 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  48.06 
 
 
557 aa  405  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  45.17 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.57 
 
 
573 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  47.54 
 
 
500 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.98 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.55 
 
 
553 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.89 
 
 
553 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  51.68 
 
 
521 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  47.57 
 
 
517 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.52 
 
 
563 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.58 
 
 
557 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  52.2 
 
 
514 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.47 
 
 
555 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  51.94 
 
 
521 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.43 
 
 
610 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  49.62 
 
 
503 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.54 
 
 
520 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  50.39 
 
 
523 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  51.16 
 
 
514 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
556 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  51.42 
 
 
521 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  46.03 
 
 
515 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  51.64 
 
 
518 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  45.36 
 
 
500 aa  390  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  48.45 
 
 
514 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
568 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.97 
 
 
568 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.61 
 
 
563 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
571 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.96 
 
 
570 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.97 
 
 
568 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  51.42 
 
 
521 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.02 
 
 
561 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  46.34 
 
 
502 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  49.75 
 
 
563 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.25 
 
 
871 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 
523 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
570 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  52.41 
 
 
520 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  52.85 
 
 
469 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40 
 
 
557 aa  387  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40 
 
 
552 aa  389  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  50.65 
 
 
521 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 
523 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  46.14 
 
 
502 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
553 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  52.41 
 
 
520 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
558 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  45.55 
 
 
550 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  50.88 
 
 
515 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  51.01 
 
 
522 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  45.49 
 
 
544 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  52.85 
 
 
469 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.42 
 
 
571 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  45.94 
 
 
541 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  51.77 
 
 
477 aa  385  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  50.76 
 
 
495 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  50.13 
 
 
521 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 
524 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  51.13 
 
 
497 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  51.13 
 
 
497 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  48.36 
 
 
499 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  51.39 
 
 
499 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  51.13 
 
 
497 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  51.13 
 
 
497 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  45.42 
 
 
569 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  42.86 
 
 
569 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  46.37 
 
 
501 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  50.13 
 
 
521 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  51.39 
 
 
499 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  51.42 
 
 
520 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  44.01 
 
 
549 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>