More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0542 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
703 aa  1417    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  45.66 
 
 
652 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  53.45 
 
 
521 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  42.19 
 
 
762 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  50.62 
 
 
430 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  48.09 
 
 
662 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.92 
 
 
792 aa  346  8.999999999999999e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  42.86 
 
 
854 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  46.73 
 
 
540 aa  339  8e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  49.27 
 
 
532 aa  332  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  48.07 
 
 
539 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  44.55 
 
 
559 aa  321  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  46.97 
 
 
651 aa  321  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  43.74 
 
 
763 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  46.6 
 
 
542 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  45.85 
 
 
414 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  47.2 
 
 
540 aa  317  4e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  47.23 
 
 
536 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  43.87 
 
 
400 aa  310  6.999999999999999e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  42.36 
 
 
425 aa  307  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  40.18 
 
 
675 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 
472 aa  271  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  36.63 
 
 
439 aa  264  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  38.65 
 
 
451 aa  261  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  40.19 
 
 
455 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  40.79 
 
 
586 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  36.45 
 
 
484 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  37.56 
 
 
674 aa  243  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  36.48 
 
 
674 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 
674 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  37.33 
 
 
674 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  36.96 
 
 
674 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  36.04 
 
 
674 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  36.48 
 
 
674 aa  239  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  36.04 
 
 
674 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  36.36 
 
 
674 aa  238  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  36.51 
 
 
674 aa  237  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.91 
 
 
674 aa  237  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  29.55 
 
 
1054 aa  229  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  28.86 
 
 
1053 aa  229  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  28.5 
 
 
1051 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  35.81 
 
 
652 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  36.05 
 
 
482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  32.7 
 
 
868 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  31.77 
 
 
372 aa  205  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.27 
 
 
868 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  33.1 
 
 
867 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.27 
 
 
848 aa  198  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.19 
 
 
869 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  31.35 
 
 
855 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 
868 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  32.06 
 
 
1146 aa  194  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 
868 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  32.86 
 
 
868 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.69 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  28.74 
 
 
1127 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  29.09 
 
 
1127 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  31.2 
 
 
639 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  34.31 
 
 
398 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  30.96 
 
 
848 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 
1127 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
1127 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  31.85 
 
 
863 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  33.67 
 
 
396 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.94 
 
 
505 aa  181  4.999999999999999e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  31.71 
 
 
1080 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.17 
 
 
868 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  32.79 
 
 
972 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  27.98 
 
 
1129 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  32.11 
 
 
382 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  28.6 
 
 
997 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  30.66 
 
 
463 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.87 
 
 
388 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 
1578 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.75 
 
 
377 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  32.89 
 
 
373 aa  152  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  31.74 
 
 
426 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  31.25 
 
 
401 aa  148  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  31.15 
 
 
431 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  29.13 
 
 
1271 aa  137  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.54 
 
 
407 aa  136  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 
355 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  28.2 
 
 
760 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 
904 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  28.3 
 
 
855 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  29.31 
 
 
861 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  27.16 
 
 
657 aa  124  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  31.95 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 
364 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  27.68 
 
 
772 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.36 
 
 
1362 aa  117  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.38 
 
 
1132 aa  115  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  32.13 
 
 
846 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  32.75 
 
 
846 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.21 
 
 
846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  35.75 
 
 
465 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.3 
 
 
634 aa  111  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  32.67 
 
 
375 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 
1443 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.32 
 
 
366 aa  104  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>