35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0478 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
863 aa  1747    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.42 
 
 
852 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  36.16 
 
 
836 aa  574  1.0000000000000001e-162  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.49 
 
 
862 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  36.25 
 
 
885 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  33.78 
 
 
858 aa  528  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  35.59 
 
 
871 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 
848 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.24 
 
 
848 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.76 
 
 
845 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.36 
 
 
850 aa  458  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.28 
 
 
831 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.14 
 
 
834 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.59 
 
 
860 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.82 
 
 
837 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  29.67 
 
 
823 aa  371  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.71 
 
 
829 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  28.31 
 
 
816 aa  361  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.78 
 
 
911 aa  361  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.82 
 
 
887 aa  303  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  30.53 
 
 
1057 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  24.81 
 
 
840 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.18 
 
 
874 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  29.46 
 
 
983 aa  118  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  23.52 
 
 
906 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.54 
 
 
923 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  25.88 
 
 
932 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.3 
 
 
910 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.47 
 
 
942 aa  97.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  27.31 
 
 
923 aa  94.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  23.32 
 
 
931 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.56 
 
 
526 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  23.05 
 
 
425 aa  50.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.41 
 
 
557 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.1 
 
 
627 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>