More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0473 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 229 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  58.26 
 
 		 234 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  57.52 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 238 aa  254  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  56.44 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 252 aa  242  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  53.54 
 
 		 239 aa  241  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  56 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  53.45 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  53.22 
 
 		 244 aa  240  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 262 aa  238  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  53.02 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  52.89 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.42 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  52.44 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  51.97 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  51.97 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  51.54 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  51.97 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  45.81 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  51.97 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  55.02 
 
 		 249 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  47.33 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 235 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  48.68 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  46.69 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  51.09 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 229 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_003296  RS01694  two component response regulator transcription regulator protein  51.08 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  46.49 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  48.25 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1844  DNA-binding transcriptional regulator RstA  50.85 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0426946 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  47.14 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1591  DNA-binding transcriptional regulator RstA  50 
 
 		 239 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01577  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with RstB  49.58 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.223446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2035  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.58 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01567  hypothetical protein  49.58 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.244563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1816  DNA-binding transcriptional regulator RstA  49.58 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0513956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2022  DNA-binding transcriptional regulator RstA  49.58 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1683  DNA-binding transcriptional regulator RstA  49.58 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2318  DNA-binding transcriptional regulator RstA  49.58 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1794  DNA-binding transcriptional regulator RstA  48.55 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0414199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2590  DNA-binding transcriptional regulator RstA  50.63 
 
 		 253 aa  208  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  48.48 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2734  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.750395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  47.75 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  49.17 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2580  DNA-binding transcriptional regulator RstA  49.17 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  47.75 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1261  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1584  DNA-binding transcriptional regulator RstA  48.94 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163508  normal  0.857869 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1643  DNA-binding transcriptional regulator RstA  48.94 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15633  normal  0.900528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1575  DNA-binding transcriptional regulator RstA  48.94 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1236  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>