More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0452 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  58.82 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  55.25 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  54.79 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  43.33 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  41.47 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.67 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  38.57 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  36.32 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  41.35 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  39.34 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.99 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.69 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  38.32 
 
 		 271 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  39.06 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  37.04 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  39.18 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 728 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.24 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  38.57 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  39.35 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  39.35 
 
 		 230 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  38.57 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  38.57 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  38.57 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  38.57 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  38.57 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.3 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  39.79 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  39.34 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  37.96 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  38.57 
 
 		 762 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  39.69 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  37.37 
 
 		 456 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  35.94 
 
 		 456 aa  112  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.98 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  38.34 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  37.37 
 
 		 456 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  38.39 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  34.95 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  38.86 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  34.72 
 
 		 707 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  33.97 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 707 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 396 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 714 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.97 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  40.22 
 
 		 204 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 710 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  31.88 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.75 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.65 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.95 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.44 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 		 220 aa  99.8  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  32.98 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  34.13 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.14 
 
 		 202 aa  99.4  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1217  HAD family sugar phosphatase  32.49 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  36.97 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  34.09 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.07 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  34.09 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  29.47 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.74 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.26 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.25 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2343  HAD family hydrolase  37.14 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0931  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.31 
 
 		 253 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.22053  normal  0.844847 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.4 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2477  HAD family hydrolase  37.14 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0922  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.84 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  38.1 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.79 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  38.04 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  37.07 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.82 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.61 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  34.04 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  32.88 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  35.6 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0990  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.480228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>