More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0257 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 404 aa  805    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 390 aa  189  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  37.53 
 
 		 386 aa  183  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  31.48 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 363 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  30.56 
 
 		 359 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  43.35 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  35.79 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  30.15 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 359 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 376 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  31.21 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  39.65 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  37.44 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  36.99 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.48 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  28.92 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  42 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  35.16 
 
 		 376 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  31.52 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  40.69 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25.14 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  36.49 
 
 		 383 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  38.68 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 399 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  40 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 402 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.77 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  32.68 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  23.98 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  38.24 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.79 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  40.2 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  27.12 
 
 		 364 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.13 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.16 
 
 		 726 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  27.45 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  29.76 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.61 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.87 
 
 		 581 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  34.22 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  32.88 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.08 
 
 		 786 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.78 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  28.02 
 
 		 361 aa  106  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 389 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  36.32 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  30.82 
 
 		 462 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  40.94 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  35.14 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  33.33 
 
 		 378 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 385 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  30 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  32.11 
 
 		 797 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  31.8 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 795 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  32.03 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 799 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 795 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.06 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  23.51 
 
 		 597 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  31.02 
 
 		 799 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>