More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0150 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  49.24 
 
 		 751 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 729 aa  1487    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  48.02 
 
 		 743 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  47.43 
 
 		 743 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  48.19 
 
 		 724 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  48.38 
 
 		 729 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  46.9 
 
 		 743 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  46.82 
 
 		 743 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  46.9 
 
 		 743 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  49.09 
 
 		 710 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  48.08 
 
 		 710 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  46.91 
 
 		 724 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  46.72 
 
 		 743 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  46.65 
 
 		 704 aa  611  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  47.58 
 
 		 712 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 		 719 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 729 aa  307  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.85 
 
 		 711 aa  280  7e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.55 
 
 		 705 aa  259  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 702 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  29.34 
 
 		 702 aa  243  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 708 aa  240  5.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 698 aa  238  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 715 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 718 aa  199  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.85 
 
 		 729 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.7 
 
 		 727 aa  194  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 727 aa  190  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.21 
 
 		 737 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 706 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 811 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  27.26 
 
 		 804 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 728 aa  188  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 774 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 742 aa  187  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 707 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  27.4 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 707 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 738 aa  184  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 716 aa  183  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 811 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 762 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 802 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 777 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 768 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 730 aa  174  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 750 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 801 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  25.1 
 
 		 729 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 801 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 754 aa  170  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 726 aa  170  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 742 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  26.73 
 
 		 722 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 753 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 727 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 728 aa  167  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 715 aa  164  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 725 aa  161  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 761 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.15 
 
 		 729 aa  161  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 718 aa  161  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 809 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 710 aa  160  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 726 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 749 aa  159  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  25.64 
 
 		 771 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 800 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 772 aa  157  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 722 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 755 aa  157  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 734 aa  157  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 805 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 737 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 772 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 772 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 823 aa  154  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 819 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  25.18 
 
 		 731 aa  153  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 757 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 709 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  24.64 
 
 		 730 aa  147  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.57 
 
 		 804 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 728 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 808 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 		 759 aa  143  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  26.29 
 
 		 746 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  24.15 
 
 		 763 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 768 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 724 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  23.84 
 
 		 724 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 706 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  23.89 
 
 		 720 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 756 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>