More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0089 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0089  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  100 
 
 		 444 aa  914    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237903  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2098  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.98 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1331  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  57.24 
 
 		 445 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.0842362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1334  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.82 
 
 		 449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0615028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2096  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  55.2 
 
 		 445 aa  501  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151011  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3491  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  54.67 
 
 		 444 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2716  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  41.93 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405721  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0621  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.78 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  33.12 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1367  hypothetical protein  30.38 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4912  hypothetical protein  30.82 
 
 		 463 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0187  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.96 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1943  microcin-processing peptidase 1  31.74 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316587  normal  0.426455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2704  hypothetical protein  28.94 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1148  hypothetical protein  29.06 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0910313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5317  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30 
 
 		 471 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5940  Zn-dependent protease  29.39 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231854  decreased coverage  0.00252026 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12337  hypothetical protein  28.69 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0288  hypothetical protein  27.64 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3439  hypothetical protein  29.53 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2275  Zn-dependent protease and their inactivated protein-like protein  29.63 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000955106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.85728  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2299  hypothetical protein  29.57 
 
 		 472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2733  hypothetical protein  27.98 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3491  hypothetical protein  29.31 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24821  normal  0.242027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3428  hypothetical protein  29.31 
 
 		 456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4320  hypothetical protein  33.57 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2189  hypothetical protein  28.69 
 
 		 459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6028  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.66 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1232  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.98 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3766  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.57 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321296 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3242  hypothetical protein  28.68 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.033407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2988  hypothetical protein  27.05 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3127  hypothetical protein  28.68 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1458  hypothetical protein  28.68 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2359  hypothetical protein  28.43 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2065  hypothetical protein  28.43 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1374  hypothetical protein  28.43 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1094  hypothetical protein  28.43 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1453  hypothetical protein  27.39 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4148  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.6 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.516156  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4996  Zn-dependent protease  26.5 
 
 		 453 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0750  Zn-dependent protease-like protein  26.59 
 
 		 439 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5246  hypothetical protein  26.43 
 
 		 445 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31840  hypothetical protein  26.43 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1146  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.43 
 
 		 454 aa  90.5  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2706  hypothetical protein  26.33 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1427  hypothetical protein  25.11 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.6198  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0326  TldD/PmbA family protein  24.34 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4999  hypothetical protein  27.36 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0591  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.79 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0324  TldD/PmbA family protein  23.66 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4950  hypothetical protein  27.08 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1210  TldD/PmbA family protein  22.95 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2696  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.5 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.781892  normal  0.389793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0278  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  25.53 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0515  hypothetical protein  27.4 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.277292  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0661  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.77 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2405  hypothetical protein  22.62 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4768  hypothetical protein  25.69 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.280128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0408  hypothetical protein  22.99 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4823  hypothetical protein  26.74 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0183457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01893  PmbA  26.24 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39830  hypothetical protein  24.84 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0754435  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0755  microcin-processing peptidase 1  22.12 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0413  microcin-processing peptidase 1  25.28 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0570132  normal  0.116989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2442  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.98 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4000  Zn-dependent protease  24.34 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.60746  hitchhiker  0.0000000571903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1559  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.12 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.792233  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0584  microcin-processing peptidase 1  25.06 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000109453  normal  0.168168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2896  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0639  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.93 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03671  peptidase PmbA  23.09 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2232  microcin-processing peptidase 1  23.19 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.352601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4261  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.35 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2323  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.33 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118827  normal  0.680287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.33 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000351423 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0200  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.75 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.06513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1845  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.52 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.1559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1735  hypothetical protein  22.73 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0971  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.3 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0235752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1053  microcin-processing peptidase 1  25.77 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0169  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.77 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0202  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.75 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0734503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1165  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.15 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.860051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3287  microcin-processing peptidase 1  21.73 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1901  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.91 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1049  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  21.28 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000445588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1735  hypothetical protein  22.5 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1234  pmbA protein  25.07 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0631  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  22.45 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002397  PmbA protein  25.12 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1709  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  23.91 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0311479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1223  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  23.57 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0414  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.94 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.273882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2836  PmbA protein  22.99 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2639  microcin-processing peptidase 1  25.9 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.818625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0597  microcin-processing peptidase 1  22.6 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0403  microcin-processing peptidase 1  23.29 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0753  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.43 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0158404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>