More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0086 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 298 aa  577  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  33.2 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  28.72 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2093  hypothetical protein  30.38 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.801588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4164  protein of unknown function DUF58  28.72 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  32.34 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  31.75 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3176  protein of unknown function DUF58  33.45 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  25.89 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4422  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.730978  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4401  protein of unknown function DUF58  30.1 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4266  hypothetical protein  29.41 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  28.01 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  32.91 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  27.66 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  29.67 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  23.32 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0206  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  27.2 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  27.31 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  28.25 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  23.73 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1008  hypothetical protein  26.07 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.842733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1420  hypothetical protein  27.19 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  27.84 
 
 		 290 aa  85.5  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1889  hypothetical protein  31.14 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.231187  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0803  hypothetical protein  25.66 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0234  hypothetical protein  25.17 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1608  hypothetical protein  31.71 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  27.08 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1933  hypothetical protein  22.73 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.401837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  28.04 
 
 		 340 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3819  hypothetical protein  31.14 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  27.63 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.22 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1737  protein of unknown function DUF58  31.53 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2793  hypothetical protein  29.12 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.588603  normal  0.242906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2905  hypothetical protein  29.67 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.299989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3057  hypothetical protein  28.74 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.023452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  24.09 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0298  hypothetical protein  29.21 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1349  hypothetical protein  24.49 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.03 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  26.94 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0485  hypothetical protein  28.62 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1557  hypothetical protein  30.57 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1505  hypothetical protein  30.57 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1294  hypothetical protein  28.74 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457214  normal  0.480101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2947  hypothetical protein  30.19 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.207971  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0724  hypothetical protein  30.19 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  22.18 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1191  hypothetical protein  28.35 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503555  normal  0.284439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3231  hypothetical protein  30.49 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0915  hypothetical protein  27.84 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  26.83 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  23.95 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2627  hypothetical protein  30 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  27 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  27.43 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1364  hypothetical protein  27.39 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.445195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2276  hypothetical protein  28.69 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.998635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1458  hypothetical protein  29.51 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.0534424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1735  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0580174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  27.85 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2222  hypothetical protein  25.27 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0136128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3083  hypothetical protein  30.11 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.850654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2270  hypothetical protein  27.78 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  30.45 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3252  hypothetical protein  27.37 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.122615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2180  hypothetical protein  28.72 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.468845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.13 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3012  protein of unknown function DUF58  29.75 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0180166  normal  0.251774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0075  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.193793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3636  hypothetical protein  31.2 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  23.45 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2405  protein of unknown function DUF58  33.1 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1375  hypothetical protein  27.45 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  24.27 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2768  hypothetical protein  32.02 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1085  protein of unknown function DUF58  31.51 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3892  hypothetical protein  31.76 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.991516  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0092  protein of unknown function DUF58  40.18 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  33.09 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  27.15 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1455  protein of unknown function DUF58  30.4 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183521  normal  0.296497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  29.39 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0684  hypothetical protein  28.89 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0785  protein of unknown function DUF58  29.69 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  40 
 
 		 575 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  21.67 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1023  hypothetical protein  33.2 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  28.98 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  36.05 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2170  hypothetical protein  31.83 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  31.6 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  37.4 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>