23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0079 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  100 
 
 
340 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  61.28 
 
 
606 aa  348  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.46 
 
 
406 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  41.63 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  36.46 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  32 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  44.12 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  37.91 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  36.19 
 
 
423 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  93.2  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  31.21 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  34.62 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  29.03 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  27.38 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  32.23 
 
 
297 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  33.05 
 
 
168 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  33.05 
 
 
168 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  24.21 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  29.27 
 
 
168 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  23.27 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0517  hypothetical protein  32.31 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  25.14 
 
 
250 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  27.19 
 
 
250 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>