More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0072 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0072  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3086  transcriptional regulator, AraC family  48.58 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0131175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3558  transcriptional regulator, AraC family  26.78 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0679  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00764856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3744  transcriptional regulator, AraC family  26.44 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1946  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.73017  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1747  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2694  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 342 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2540  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 351 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1692  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3532  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113977 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1776  helix-turn-helix domain-containing protein  28.43 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.65 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0411  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3031  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000013989  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  31.18 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  44.16 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1670  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1481  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0934  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0397  AraC-family transcriptional regulator  24 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0403  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000043058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  29.93 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0394  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000164357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0457  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000383728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2545  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0415  AraC-family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1829  AraC family transcription regulator  35.37 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0050  thermoregulatory protein LcrF  29.9 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.24501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0841  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0876  regulatory protein PchR  35.37 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0492  helix-turn-helix domain-containing protein  27.06 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  30.88 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2149  AraC family transcription regulator  35.37 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0183353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5288  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0305089  normal  0.89359 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0786  regulatory protein PchR  35.37 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  34.15 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0681  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  34.15 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  26.76 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000327  transcriptional regulator AraC family  22.59 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000791228  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3774  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  31.71 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7195  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2517  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.94 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4154  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0895  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3074  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.618991  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6017  transcriptional regulator, AraC family  24.14 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0457  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.761894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0422  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  30.49 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5347  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.93449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  28.89 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1734  transcriptional regulator, AraC family  37.18 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 		 773 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0301  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  29.91 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0423  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  32.31 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  27.91 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1981  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>