More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0071 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  100 
 
 		 373 aa  739    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  42.57 
 
 		 496 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  34.36 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  25.07 
 
 		 483 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.46 
 
 		 477 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.92 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  27.03 
 
 		 462 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.12 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.94 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.69 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.79 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.15 
 
 		 547 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.07 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.43 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.92 
 
 		 445 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.34 
 
 		 578 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  32.83 
 
 		 611 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.72 
 
 		 603 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.39 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.03 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.97 
 
 		 593 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.02 
 
 		 470 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.91 
 
 		 537 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  29.97 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  30.17 
 
 		 539 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.37 
 
 		 559 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.62 
 
 		 498 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.24 
 
 		 453 aa  109  9.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.62 
 
 		 498 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  33.22 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  31.13 
 
 		 338 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  26.2 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  26.2 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.65 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  22.92 
 
 		 434 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  23.75 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  28.71 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.86 
 
 		 493 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.83 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  23.4 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  23.4 
 
 		 543 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.01 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.83 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  24.86 
 
 		 1055 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  24.28 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  24.23 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.9 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  26.45 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  26.18 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 412 aa  99.8  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  24.9 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.9 
 
 		 421 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  25.78 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 415 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 416 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  31.32 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.85 
 
 		 422 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.51 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  24.28 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  25.82 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  24.43 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.52 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  25.82 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  25.82 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.32 
 
 		 505 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  23.55 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  23.99 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.16 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  25.59 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  23.78 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.12 
 
 		 446 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.21 
 
 		 520 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  29.04 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.42 
 
 		 404 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  24.42 
 
 		 369 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.73 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  23.42 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.71 
 
 		 519 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  23.42 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.02 
 
 		 529 aa  93.6  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  27.53 
 
 		 338 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  23.72 
 
 		 669 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.72 
 
 		 662 aa  92.8  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  26.2 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.83 
 
 		 803 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  30.1 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.51 
 
 		 1032 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.72 
 
 		 544 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.19 
 
 		 595 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.14 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.92 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  30.21 
 
 		 553 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  30.12 
 
 		 479 aa  89  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  25.47 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  26.11 
 
 		 482 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  30.08 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27 
 
 		 848 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  28.77 
 
 		 517 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>