54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0030 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0030  cysteine dioxygenase type I  100 
 
 
218 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174778  hitchhiker  0.0000000079419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1882  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0884885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2507  cysteine dioxygenase type I  34.19 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0215877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2378  hypothetical protein  32.48 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2657  hypothetical protein  34.19 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2667  hypothetical protein  32.81 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0160743 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2701  hypothetical protein  32.48 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2660  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000212284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2415  hypothetical protein  31.62 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2651  hypothetical protein  31.62 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2633  hypothetical protein  31.62 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2453  hypothetical protein  31.62 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00159574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1341  hypothetical protein  30.99 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1987  cysteine dioxygenase type I  38.89 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.935049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4259  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00114989  normal  0.276008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2159  hypothetical protein  34.62 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244968  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3258  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4107  cysteine dioxygenase type I  28.57 
 
 
188 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1508  metal-dependent protein of the double-stranded beta helix superfamily-like protein  33.13 
 
 
171 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.221048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5233  cysteine dioxygenase type I  32.5 
 
 
198 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184796  normal  0.220688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1914  hypothetical protein  28.69 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1656  cysteine dioxygenase type I  30.83 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4331  cysteine dioxygenase type I  30.05 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.173506 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2216  cysteine dioxygenase type I  30.08 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100364  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3601  hypothetical protein  31.01 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0862  hypothetical protein  30.95 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186079  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1548  cysteine dioxygenase type I  31.36 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0608  hypothetical protein  31.75 
 
 
143 aa  52.4  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30970  cysteine dioxygenase type I protein  31.16 
 
 
202 aa  52  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2664  cysteine dioxygenase type I  30.83 
 
 
207 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000978077  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2674  cysteine dioxygenase type I  32.58 
 
 
201 aa  51.6  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4156  cysteine dioxygenase type I  26.92 
 
 
188 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.793001  normal  0.481367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3576  cysteine dioxygenase type I  30.57 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3683  cysteine dioxygenase type I  27.07 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1793  hypothetical protein  33.05 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1712  cysteine dioxygenase type I  32.58 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3544  cysteine dioxygenase type I  30.07 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.272534  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5045  cysteine dioxygenase type I  30.77 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3875  cysteine dioxygenase type I  29.66 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0873  cysteine dioxygenase type I  21.93 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2687  cysteine dioxygenase type I  23.81 
 
 
199 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.503758  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1752  double-stranded beta helix superfamily protein  26.37 
 
 
188 aa  48.1  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188529  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3216  hypothetical protein  28.45 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.460975  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30440  putative enzyme  33.33 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5442  cysteine dioxygenase type I  31.41 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3618  cysteine dioxygenase type I  26.28 
 
 
188 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.233874  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4463  cysteine dioxygenase type I  30.17 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5454  hypothetical protein  31 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4597  cysteine dioxygenase type I  30.17 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.459567  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1387  cysteine dioxygenase type I  30.77 
 
 
178 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240375  normal  0.0417465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2513  cysteine dioxygenase type I  27.97 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0454  cysteine dioxygenase type I  32.73 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1609  cysteine dioxygenase type I  31.69 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2860  cysteine dioxygenase type I family protein  35.92 
 
 
218 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0476515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>