More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0028 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
342 aa  692    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  87.72 
 
 
342 aa  618  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  85.88 
 
 
343 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  86.18 
 
 
343 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  81.18 
 
 
347 aa  584  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  81.58 
 
 
344 aa  579  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  81.29 
 
 
342 aa  574  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  80.94 
 
 
348 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  78.82 
 
 
342 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  78.95 
 
 
344 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  78.95 
 
 
344 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  75.95 
 
 
342 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  78.01 
 
 
341 aa  550  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  78.36 
 
 
344 aa  551  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  78.72 
 
 
344 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  76.83 
 
 
342 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  76.18 
 
 
344 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  73.53 
 
 
341 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  73.37 
 
 
342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  72.65 
 
 
341 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  72.65 
 
 
340 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  71.89 
 
 
342 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  71.89 
 
 
342 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  72.19 
 
 
342 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  72.49 
 
 
341 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  70.59 
 
 
341 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.89 
 
 
341 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.89 
 
 
341 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.89 
 
 
341 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  71.89 
 
 
357 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.89 
 
 
341 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  71.89 
 
 
341 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  71.18 
 
 
342 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  70.88 
 
 
342 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  68.53 
 
 
342 aa  500  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  73.35 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  65.29 
 
 
342 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  66.08 
 
 
342 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.29 
 
 
337 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  65.19 
 
 
344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  64.58 
 
 
337 aa  441  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  63.24 
 
 
340 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.35 
 
 
340 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  64.9 
 
 
341 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  63.34 
 
 
342 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  61.65 
 
 
343 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  60.06 
 
 
344 aa  421  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  66.47 
 
 
339 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  58.02 
 
 
344 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  64.01 
 
 
368 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  58.63 
 
 
336 aa  398  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  57.78 
 
 
336 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  55.32 
 
 
341 aa  359  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.71 
 
 
336 aa  354  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.23 
 
 
336 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  55.93 
 
 
341 aa  345  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.8 
 
 
350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  46.75 
 
 
338 aa  294  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  45.91 
 
 
340 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
345 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  46.02 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 
345 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  45.88 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 
380 aa  283  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  46.18 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  43.66 
 
 
336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  45.98 
 
 
350 aa  282  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 
342 aa  278  8e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.97 
 
 
336 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1683  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
336 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1776  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
336 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1598  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
336 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1744  alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
336 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.67 
 
 
347 aa  271  9e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1681  alcohol dehydrogenase  47.77 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  43.99 
 
 
340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2066  alcohol dehydrogenase  46.15 
 
 
336 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  45.72 
 
 
337 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
336 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
336 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  46.59 
 
 
336 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.48 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 
336 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.08 
 
 
336 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 
336 aa  263  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  48.08 
 
 
336 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 
336 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.27 
 
 
336 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
336 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3839  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3554  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00710  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  42.82 
 
 
361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.797192  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00600  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  43.71 
 
 
422 aa  245  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>