More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0021 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
400 aa  820  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17324e-08 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  80.7 
 
 
400 aa  679  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  69.5 
 
 
400 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  69.5 
 
 
400 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  62 
 
 
399 aa  505  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 
398 aa  506  1e-142  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  62.81 
 
 
398 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  61.31 
 
 
398 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  61.56 
 
 
398 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 
398 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  62.81 
 
 
398 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  59.65 
 
 
402 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  61.31 
 
 
398 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  61.31 
 
 
398 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  63.25 
 
 
399 aa  491  1e-138  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  62.25 
 
 
399 aa  492  1e-138  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  62.47 
 
 
399 aa  493  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  60.55 
 
 
399 aa  484  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  62.75 
 
 
399 aa  488  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  62.98 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  61.44 
 
 
399 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  62.98 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  62.98 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  57.29 
 
 
398 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  61.4 
 
 
398 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  62.06 
 
 
398 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  62.98 
 
 
399 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  63.24 
 
 
399 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  57.29 
 
 
398 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  58.29 
 
 
398 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  63.24 
 
 
399 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  61.06 
 
 
399 aa  481  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  57.79 
 
 
398 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  57.79 
 
 
398 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  59.3 
 
 
398 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  59.55 
 
 
398 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  57.04 
 
 
398 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  60.3 
 
 
398 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  60.05 
 
 
398 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  60.05 
 
 
398 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  56.53 
 
 
398 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  58.87 
 
 
396 aa  465  1e-130  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  56.53 
 
 
398 aa  468  1e-130  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  59.3 
 
 
398 aa  467  1e-130  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  55.61 
 
 
401 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  57.75 
 
 
402 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
398 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  51.37 
 
 
401 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
397 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  52.76 
 
 
398 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  52.76 
 
 
398 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 
397 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  2.01349e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  52.76 
 
 
398 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
397 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
397 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
397 aa  417  1e-115  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
397 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  50.76 
 
 
401 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
399 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  52.01 
 
 
398 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  50.99 
 
 
402 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  50.74 
 
 
399 aa  411  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  51.13 
 
 
398 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
396 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
396 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  49.11 
 
 
397 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
396 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.17501e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
397 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.24444e-05  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  49.75 
 
 
399 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  406  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
397 aa  407  1e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  51.88 
 
 
397 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
397 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  50.51 
 
 
396 aa  408  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 
397 aa  408  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.56913e-06  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
396 aa  405  1e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
397 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  51.89 
 
 
399 aa  407  1e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  49.24 
 
 
397 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  49.49 
 
 
396 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  49.49 
 
 
396 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
396 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  51.63 
 
 
397 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
396 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>