More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0012 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 
486 aa  980    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  72.43 
 
 
486 aa  669    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2652  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.89 
 
 
481 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3504  phospholipase D/transphosphatidylase  49.89 
 
 
484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00223299  normal  0.671494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  37.32 
 
 
514 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  37.42 
 
 
514 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.62 
 
 
486 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  37.42 
 
 
514 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  316  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  316  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  37.21 
 
 
514 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  42 
 
 
486 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  38.12 
 
 
502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1900  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.41 
 
 
486 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0592  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0536  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0536  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0625  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.99299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4675  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
509 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.632299999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0662  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
509 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0680  cardiolipin synthetase  34.98 
 
 
509 aa  301  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000786152 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  34.49 
 
 
509 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  36.91 
 
 
502 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.04 
 
 
477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.73 
 
 
482 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  35.93 
 
 
485 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.84 
 
 
541 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  34.62 
 
 
490 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.69 
 
 
478 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 
483 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  35.74 
 
 
479 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  36.22 
 
 
477 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  36.22 
 
 
477 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  35.76 
 
 
479 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.92 
 
 
483 aa  259  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.87 
 
 
472 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  36.36 
 
 
479 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  36.36 
 
 
479 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2866  phospholipase D/transphosphatidylase  35.19 
 
 
482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
478 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.5 
 
 
492 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1345  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.9049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2073  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1570  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.657413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2598  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2509  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3239  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  35.34 
 
 
481 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  34.83 
 
 
479 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2453  cardiolipin synthetase  35.46 
 
 
479 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081727  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4057  cardiolipin synthetase  36.01 
 
 
518 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.960389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  38.93 
 
 
481 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  32.79 
 
 
480 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1418  cardiolipin synthase  31.82 
 
 
476 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.283904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  30.86 
 
 
494 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  35.02 
 
 
483 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4724  cardiolipin synthetase  35.86 
 
 
505 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129159  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  30.86 
 
 
494 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1683  cardiolipin synthase  31.82 
 
 
476 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.02 
 
 
485 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1666  cardiolipin synthetase  35.33 
 
 
483 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  34.23 
 
 
479 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0187  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.48 
 
 
526 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2012  cardiolipin synthetase  36.7 
 
 
479 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1211  cardiolipin synthetase  36.46 
 
 
489 aa  246  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.298817  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  35.34 
 
 
479 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_002950  PG1647  cardiolipin synthetase  32.5 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1243  cardiolipin synthetase  36.78 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.35 
 
 
478 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2066  cardiolipin synthetase  35.74 
 
 
479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.941706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  36.47 
 
 
478 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.71 
 
 
478 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0582  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.7 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  31.01 
 
 
488 aa  243  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  30.75 
 
 
470 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  34.36 
 
 
477 aa  243  7e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  34.75 
 
 
477 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6043  cardiolipin synthetase  36.57 
 
 
479 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0735  cardiolipin synthetase  29.44 
 
 
483 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00981982  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2034  cardiolipin synthetase  36.57 
 
 
479 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0748  cardiolipin synthetase  29.44 
 
 
483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.83977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0385  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.82 
 
 
508 aa  240  4e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  37.01 
 
 
481 aa  240  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0682  cardiolipin synthetase  32.01 
 
 
441 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5530  cardiolipin synthetase  32.68 
 
 
479 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.61 
 
 
490 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.79 
 
 
499 aa  237  4e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  34.54 
 
 
480 aa  236  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.9 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5079  cardiolipin synthetase  33.33 
 
 
479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71220  cardiolipin synthetase  34.9 
 
 
490 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2511  cardiolipin synthetase  33.06 
 
 
490 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6180  cardiolipin synthetase  34.49 
 
 
491 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>