42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0007 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0007  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 395 aa  796    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0101354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03477  tetratricopeptide repeat domain protein  73.42 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0008  hypothetical protein  62.89 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0008  TPR repeat-containing protein  61.79 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1259  TPR domain-containing protein  24.93 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644496  hitchhiker  0.000203167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2985  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252966  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00632  hypothetical protein  25.58 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001861  tPR domain protein putative component of TonB system  23.62 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1630  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.298427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1645  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.300353  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2713  Tetratricopeptide domain protein  24.57 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0190372  decreased coverage  0.0000000186739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2473  tetratricopeptide domain-containing protein  22.29 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0521171  hitchhiker  0.0000640342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1829  TPR domain-containing protein  22.92 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1522  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2420  tetratricopeptide region  22.74 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3751  TPR domain-containing protein  23.51 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.591337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2459  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230819  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2621  tetratricopeptide domain-containing protein  23.58 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.15781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2621  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.669911  hitchhiker  0.00000025253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2529  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159462  unclonable  0.0000288017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1667  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854657  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0611  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000267471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2647  tetratricopeptide domain-containing protein  22.06 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0256844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1065  tetratricopeptide TPR_2  22.97 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1576  tetratricopeptide domain-containing protein  20.6 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0116685  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03430  putative unknown membrane associated protein  24.25 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02809  TPR domain protein  22.02 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3074  tetratricopeptide domain-containing protein  21.48 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 280 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 562 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2343  hypothetical protein  21.79 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  hitchhiker  0.00990009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.37 
 
 		 715 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 1297 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0357  putative PAS/PAC sensor protein  25.37 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.302705  normal  0.695639 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.17 
 
 		 725 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3971  TPR domain-containing protein  23.64 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  22.5 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000843  tPR domain protein putative component of TonB system  23.66 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  26.06 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  28.09 
 
 		 579 aa  43.1  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>