264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0037 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0037  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000333812  normal  0.463641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0057  tRNA-Tyr  91.18 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.343924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  90.14 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  90.14 
 
 		 88 bp  85.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  90.54 
 
 		 87 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0043  tRNA-Tyr  91.53 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0206397  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt06  tRNA-Tyr  86.42 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  89.23 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  90.16 
 
 		 86 bp  73.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PGt10  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.882625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0010  tRNA-Tyr  91.07 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00640732  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0014  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.64782e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0005  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.309794  hitchhiker  0.000058152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0019  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  95.45 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0021  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.359257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0002  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 86 bp  69.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000899619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0013  tRNA-Tyr  87.34 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t006  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t045  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t046  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t047  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0013  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000242624  normal  0.0244003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0095  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000654361  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0096  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00070521  normal  0.980641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0097  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186117  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0013  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000911406  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0093  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00406786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0094  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000412805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0095  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000439573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0013  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000166479  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0092  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0093  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000411147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0094  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0011  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000044302  hitchhiker  0.000585411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0070  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.157981  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0071  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0977282  normal  0.857098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0072  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0964412  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  86.76 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0007  tRNA-Tyr  84.52 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0018  tRNA-Tyr  86.76 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000576099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0044  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  93.18 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  93.18 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  93.62 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  93.62 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0068  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112006  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t076  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00524716  normal  0.153954 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.63004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0066  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.119149  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0071  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719638  normal  0.0567471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.926918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0070  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.531794  normal  0.0573662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0014  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000873726  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t006  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000887423  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0076  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  86.36 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0069  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.548705  normal  0.0555108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1717  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000393409  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1468  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000829322  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  87.88 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>