239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6939 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
417 aa  858  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  68.69 
 
 
411 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  65.85 
 
 
410 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  56.48 
 
 
457 aa  501  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  53.06 
 
 
412 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  53.06 
 
 
412 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.31 
 
 
416 aa  424  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  51.6 
 
 
420 aa  421  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  52.32 
 
 
408 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18836e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  51.09 
 
 
408 aa  415  1e-115  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.61 
 
 
408 aa  417  1e-115  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  50.36 
 
 
408 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.85 
 
 
408 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.59992e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  50.36 
 
 
408 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  48.39 
 
 
461 aa  407  1e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  48.39 
 
 
461 aa  407  1e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  46.13 
 
 
451 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.63 
 
 
453 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 
426 aa  201  2e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  35.16 
 
 
417 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 
412 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.11038e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  32.3 
 
 
410 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  34.69 
 
 
361 aa  184  2e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  33.61 
 
 
406 aa  184  2e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.44 
 
 
403 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.41 
 
 
414 aa  182  8e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.95 
 
 
409 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  35.12 
 
 
367 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.78626e-15  hitchhiker  6.08481e-12 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.13 
 
 
412 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  28.67 
 
 
414 aa  175  1e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.67 
 
 
402 aa  175  2e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  33.06 
 
 
401 aa  175  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.38 
 
 
416 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.81 
 
 
359 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.73 
 
 
446 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 
405 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  30.71 
 
 
405 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.49 
 
 
408 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.32 
 
 
406 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.52 
 
 
415 aa  167  3e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.98483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  34.2 
 
 
409 aa  165  1e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.18 
 
 
402 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
403 aa  164  4e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.28 
 
 
407 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  34.05 
 
 
406 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 
401 aa  161  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.73 
 
 
369 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
369 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  32.88 
 
 
414 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.59 
 
 
369 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  31.32 
 
 
379 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  33.24 
 
 
417 aa  156  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.99 
 
 
400 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.23 
 
 
370 aa  152  9e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 
402 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.33 
 
 
400 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.99 
 
 
409 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.41 
 
 
363 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.97 
 
 
405 aa  147  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.52 
 
 
369 aa  146  7e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.43 
 
 
372 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  33.71 
 
 
407 aa  140  4e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  29.74 
 
 
407 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.86 
 
 
434 aa  137  3e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.47 
 
 
415 aa  132  8e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  28.67 
 
 
414 aa  132  1e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.88 
 
 
428 aa  129  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.88 
 
 
428 aa  129  1e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  5.38057e-06 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  32.52 
 
 
405 aa  128  2e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.75 
 
 
376 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  32.23 
 
 
349 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  31.18 
 
 
453 aa  123  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  4.33271e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.28 
 
 
419 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.52 
 
 
431 aa  121  2e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.38 
 
 
437 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.19 
 
 
409 aa  120  4e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.94 
 
 
415 aa  119  1e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  5.68946e-05 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  28.65 
 
 
420 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 
430 aa  115  1e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  30.72 
 
 
440 aa  115  2e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  26.33 
 
 
600 aa  114  2e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.65 
 
 
429 aa  114  2e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  27.71 
 
 
437 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 
445 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  3.89133e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  29.48 
 
 
431 aa  114  4e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.84 
 
 
425 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  29.38 
 
 
427 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  29.65 
 
 
425 aa  112  1e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
414 aa  112  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.01 
 
 
501 aa  111  2e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.44 
 
 
418 aa  112  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.44 
 
 
418 aa  112  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  28.32 
 
 
423 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  28.44 
 
 
418 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  28.68 
 
 
424 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.18 
 
 
414 aa  109  9e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  28.46 
 
 
419 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  28.31 
 
 
406 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.06 
 
 
414 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  30.31 
 
 
425 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>