17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6938 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  49.14 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  51.11 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  39.5 
 
 		 131 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  43.02 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  43.02 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  41.86 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  45.45 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  35.42 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  40.7 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  40.66 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  39.56 
 
 		 113 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  39.53 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  37.29 
 
 		 116 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  28.71 
 
 		 391 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  33.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2837  hypothetical protein  30.38 
 
 		 218 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>