279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6744 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  65.61 
 
 		 739 aa  999    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 731 aa  1499    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  54.61 
 
 		 736 aa  826    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  40.51 
 
 		 821 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 798 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 813 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  32.33 
 
 		 807 aa  362  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  33.33 
 
 		 846 aa  361  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 696 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  24.73 
 
 		 690 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 782 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 675 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  23.39 
 
 		 703 aa  103  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  25.61 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 687 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.64 
 
 		 705 aa  98.6  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 700 aa  94.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  23.02 
 
 		 711 aa  94  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.42 
 
 		 782 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 782 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  22.24 
 
 		 710 aa  89  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 704 aa  87.8  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.46 
 
 		 774 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 777 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.61 
 
 		 774 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  24.48 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.56 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.81 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.15 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 693 aa  81.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.7 
 
 		 784 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 721 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  21.99 
 
 		 774 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  21.99 
 
 		 774 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 774 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  21.99 
 
 		 774 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  21.99 
 
 		 774 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 518 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  23.57 
 
 		 701 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 734 aa  74.7  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.21 
 
 		 809 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 721 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 728 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  21.83 
 
 		 809 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.12 
 
 		 809 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  23.32 
 
 		 690 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 706 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  27.89 
 
 		 717 aa  69.3  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  21.59 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 731 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  21.11 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 678 aa  66.6  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  27.52 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  22.02 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  23 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 702 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 732 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 720 aa  62.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 730 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 800 aa  62.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 710 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 700 aa  60.8  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 686 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 696 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 770 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 644 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 757 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 729 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 727 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  30.56 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.84 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.84 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.84 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.84 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  22.98 
 
 		 757 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 638 aa  57  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  26.95 
 
 		 737 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 700 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.52 
 
 		 721 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  27.51 
 
 		 696 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.24 
 
 		 726 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 709 aa  56.6  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 718 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 720 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 698 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 700 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 714 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  22.86 
 
 		 776 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 700 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 700 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>