241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6742 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  43.62 
 
 
199 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  42.93 
 
 
195 aa  170  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  30.32 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  30.32 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  30.32 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  30.32 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  28.26 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  31.55 
 
 
372 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
67 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
758 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  41.79 
 
 
74 aa  57.8  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40.91 
 
 
954 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  40.3 
 
 
70 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
942 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  38.81 
 
 
74 aa  55.5  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
750 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
759 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  35.82 
 
 
91 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
91 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
871 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  41.67 
 
 
67 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  31.43 
 
 
98 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
890 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  30.77 
 
 
108 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
471 aa  52.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  35.82 
 
 
91 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  35.94 
 
 
91 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
67 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  35.82 
 
 
98 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
90 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  34.38 
 
 
91 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  35.94 
 
 
91 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  35.94 
 
 
91 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  35.94 
 
 
91 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  35.94 
 
 
91 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  35.94 
 
 
91 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  35.94 
 
 
91 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  35 
 
 
67 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  35.94 
 
 
91 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
759 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
753 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  27.96 
 
 
818 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
759 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
866 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  31.75 
 
 
68 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  31.75 
 
 
68 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  30.65 
 
 
68 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  42.37 
 
 
560 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 
889 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 
889 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
802 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  32.84 
 
 
551 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 
68 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  35.59 
 
 
78 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  28.05 
 
 
839 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  41.67 
 
 
550 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 
68 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 
65 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  31.15 
 
 
67 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  31.15 
 
 
67 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  35.94 
 
 
91 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
70 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  35.94 
 
 
91 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
797 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
836 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
891 aa  48.9  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.25 
 
 
799 aa  48.5  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  36.92 
 
 
562 aa  48.9  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
743 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.07 
 
 
68 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
857 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
499 aa  48.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  35 
 
 
67 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  35 
 
 
68 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  30.7 
 
 
117 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
894 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 
798 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  37.5 
 
 
70 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  31.08 
 
 
123 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
805 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
805 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
805 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  30.43 
 
 
74 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  23.26 
 
 
825 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  32.79 
 
 
68 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  34.92 
 
 
108 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
805 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
805 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  31.43 
 
 
74 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
887 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  37.93 
 
 
99 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
752 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  31.34 
 
 
94 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  32.79 
 
 
67 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 
724 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
821 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
723 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  37.29 
 
 
77 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  30.88 
 
 
805 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>