62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6722 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 1674 aa  3435    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  32.44 
 
 		 2077 aa  663    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  32.25 
 
 		 1669 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  32.41 
 
 		 1669 aa  622  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  30.94 
 
 		 2098 aa  622  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 1642 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  31.02 
 
 		 1706 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  29.99 
 
 		 1934 aa  589  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  29.86 
 
 		 1932 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  29.88 
 
 		 1726 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 		 1693 aa  571  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  30.63 
 
 		 1649 aa  543  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  31.24 
 
 		 1703 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  28.88 
 
 		 1697 aa  539  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  30.11 
 
 		 1700 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  30.37 
 
 		 1702 aa  533  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1748 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  28.43 
 
 		 1697 aa  516  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  29.72 
 
 		 1701 aa  516  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 1516 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  29.5 
 
 		 1606 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  30.8 
 
 		 1417 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  28.41 
 
 		 2570 aa  485  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  29.51 
 
 		 1575 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.43 
 
 		 2117 aa  472  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  28.92 
 
 		 1956 aa  459  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.23 
 
 		 1722 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  29.56 
 
 		 1925 aa  373  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.03 
 
 		 2274 aa  367  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  27 
 
 		 1594 aa  344  9e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  29.07 
 
 		 1211 aa  307  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  26.89 
 
 		 2005 aa  271  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  25.61 
 
 		 761 aa  242  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  32.15 
 
 		 763 aa  227  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 976 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  32.94 
 
 		 470 aa  154  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  30.92 
 
 		 526 aa  148  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  29.58 
 
 		 766 aa  139  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  32.42 
 
 		 284 aa  107  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  27.47 
 
 		 678 aa  73.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  25.62 
 
 		 1328 aa  72.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  30.32 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  26.14 
 
 		 341 aa  64.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  26.24 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  24.75 
 
 		 339 aa  58.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  34.95 
 
 		 1379 aa  56.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  28.08 
 
 		 595 aa  53.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  33.33 
 
 		 933 aa  53.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.36 
 
 		 894 aa  53.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  20.87 
 
 		 468 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  33.64 
 
 		 900 aa  52  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1016  N-6 DNA methylase  31.68 
 
 		 485 aa  50.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  25.59 
 
 		 481 aa  49.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4455  N-6 DNA methylase  25.35 
 
 		 492 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.435107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.37 
 
 		 995 aa  47.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  27.01 
 
 		 481 aa  47.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.04 
 
 		 953 aa  47  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1036 aa  47  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.57 
 
 		 957 aa  46.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  30.29 
 
 		 449 aa  46.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  28.81 
 
 		 986 aa  46.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 450 aa  45.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>