More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6623 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  255  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  61.42 
 
 		 126 aa  173  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  61.42 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  60.32 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  60.32 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  61.11 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  58.27 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  55.12 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  55.56 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  56.69 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  55.91 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  50.41 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  53.54 
 
 		 127 aa  143  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  50.81 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0573  glycine cleavage system protein H  51.56 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  48.82 
 
 		 126 aa  140  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  52.89 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.61 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  51.59 
 
 		 125 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 129 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  46.77 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 126 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  47.58 
 
 		 129 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 129 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 127 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  47.24 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  47.2 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  51.64 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  49.19 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  127  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  45.24 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1432  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>