52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6571 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  100 
 
 		 1342 aa  2733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  60.25 
 
 		 1314 aa  983    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  66.5 
 
 		 1259 aa  1409    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  61.48 
 
 		 1656 aa  156  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  40.69 
 
 		 1216 aa  145  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  46.41 
 
 		 823 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.09 
 
 		 11716 aa  92  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  32.8 
 
 		 859 aa  90.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  33.69 
 
 		 2853 aa  89.7  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  46.79 
 
 		 4231 aa  88.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  51.04 
 
 		 4465 aa  86.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  34.91 
 
 		 872 aa  86.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 1728 aa  85.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  41.1 
 
 		 295 aa  84  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  32.21 
 
 		 2820 aa  84  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  45.38 
 
 		 2001 aa  83.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.64 
 
 		 3598 aa  82.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  38.13 
 
 		 2337 aa  78.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  42.59 
 
 		 1610 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  47.92 
 
 		 2954 aa  75.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  41.75 
 
 		 1610 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  39.6 
 
 		 3026 aa  70.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.98 
 
 		 1019 aa  70.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.21 
 
 		 2701 aa  68.6  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  41.94 
 
 		 1055 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.72 
 
 		 5769 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  41.23 
 
 		 2132 aa  67.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  36.09 
 
 		 2506 aa  65.9  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.95 
 
 		 3209 aa  65.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  35.29 
 
 		 5094 aa  65.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  26.94 
 
 		 727 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  27.69 
 
 		 743 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  24.09 
 
 		 962 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  25.62 
 
 		 708 aa  57.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  26.22 
 
 		 729 aa  56.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45737  predicted protein  31.71 
 
 		 882 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.194505  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.22 
 
 		 2182 aa  54.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3272  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 		 1095 aa  52.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333117  normal  0.0421668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  38.82 
 
 		 5020 aa  52  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  26.89 
 
 		 663 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48710  predicted protein  25.61 
 
 		 969 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.873734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  36.9 
 
 		 3222 aa  49.3  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  28 
 
 		 1100 aa  48.5  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.18 
 
 		 3977 aa  48.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  32.94 
 
 		 3230 aa  48.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  22.22 
 
 		 727 aa  48.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  33.77 
 
 		 1081 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0296  Ig family protein  37.35 
 
 		 1699 aa  46.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  30.05 
 
 		 731 aa  46.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  35 
 
 		 243 aa  46.2  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  29.5 
 
 		 726 aa  45.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  23.44 
 
 		 738 aa  45.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>