More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6545 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 188 aa  389  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  55 
 
 		 182 aa  213  9e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  52.25 
 
 		 265 aa  202  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  53.89 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  51.1 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 192 aa  121  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 180 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  32.94 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 178 aa  91.3  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 281 aa  85.1  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 166 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  31.87 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  31.18 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  38.4 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  30.64 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  30.46 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  31.51 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  30.67 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  31.65 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  28.32 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  30.95 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  27.37 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.87 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  29.41 
 
 		 176 aa  72  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  30.17 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  29.82 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>