More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6524 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  69.97 
 
 
294 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  61.09 
 
 
295 aa  360  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  57.29 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  55.86 
 
 
294 aa  318  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  53.58 
 
 
286 aa  299  4e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  51.36 
 
 
289 aa  295  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  50 
 
 
295 aa  292  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  50.51 
 
 
290 aa  290  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.65 
 
 
291 aa  278  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.62 
 
 
291 aa  269  4e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  49.66 
 
 
290 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.96 
 
 
291 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.64 
 
 
292 aa  262  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.12 
 
 
287 aa  260  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 
287 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.94 
 
 
287 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.03 
 
 
289 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 
287 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.07 
 
 
288 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.64 
 
 
293 aa  258  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.76 
 
 
288 aa  254  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.3 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.22 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  43.73 
 
 
309 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
288 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.81 
 
 
288 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.69 
 
 
294 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.05 
 
 
299 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  43.3 
 
 
287 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.18 
 
 
291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  48.38 
 
 
270 aa  232  5e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.71 
 
 
290 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.02 
 
 
290 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 
290 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 
290 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.3 
 
 
283 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.61 
 
 
290 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.47 
 
 
298 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.47 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.03 
 
 
289 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.38 
 
 
295 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.08 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  38 
 
 
345 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.91 
 
 
288 aa  217  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.52 
 
 
294 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.39 
 
 
293 aa  218  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.68 
 
 
286 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
286 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.41 
 
 
293 aa  216  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.61 
 
 
296 aa  215  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.96 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.25 
 
 
283 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.75 
 
 
290 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.75 
 
 
290 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.78 
 
 
288 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.78 
 
 
288 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 
292 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.72 
 
 
291 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.72 
 
 
290 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
291 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  38.44 
 
 
292 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  39.41 
 
 
305 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
286 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.74 
 
 
290 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.2 
 
 
296 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0558  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.79 
 
 
291 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  40.48 
 
 
287 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.26 
 
 
286 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.67 
 
 
295 aa  206  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 
290 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
288 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.44 
 
 
288 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 
285 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2830  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
293 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  37.75 
 
 
295 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0172  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.28 
 
 
291 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  38.91 
 
 
287 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.66 
 
 
286 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  39.59 
 
 
286 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 
298 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 
296 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.64 
 
 
286 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  39.6 
 
 
294 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.06 
 
 
287 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 
291 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
286 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.78 
 
 
287 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.32 
 
 
286 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 
291 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>