More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6513 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  100 
 
 		 613 aa  1230    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  51.37 
 
 		 613 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  52.67 
 
 		 607 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  51.88 
 
 		 611 aa  599  1e-170  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  48.53 
 
 		 610 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  47.23 
 
 		 612 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  45.23 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  43 
 
 		 609 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  44.36 
 
 		 566 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  40.95 
 
 		 608 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  38.66 
 
 		 649 aa  419  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  36.36 
 
 		 647 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 		 634 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  37.8 
 
 		 639 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  40.88 
 
 		 579 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  37.32 
 
 		 632 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  41.63 
 
 		 582 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  37.08 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  42.69 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  42.8 
 
 		 572 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.88 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  43.2 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  37.75 
 
 		 589 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  37.97 
 
 		 634 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  38.02 
 
 		 611 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  36.27 
 
 		 571 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  40.53 
 
 		 582 aa  372  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.13 
 
 		 611 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.96 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  42.42 
 
 		 578 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  42.38 
 
 		 575 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 598 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.11 
 
 		 580 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  41.6 
 
 		 546 aa  362  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35.93 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  42.02 
 
 		 580 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.29 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  39.77 
 
 		 614 aa  359  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  41.83 
 
 		 580 aa  359  7e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  41.13 
 
 		 578 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  38.58 
 
 		 584 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  41.11 
 
 		 598 aa  353  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.4 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  38.65 
 
 		 627 aa  352  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  40.7 
 
 		 550 aa  351  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  42.51 
 
 		 598 aa  350  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  42.31 
 
 		 601 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.91 
 
 		 597 aa  347  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.67 
 
 		 613 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  36.99 
 
 		 584 aa  346  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.91 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.12 
 
 		 600 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.91 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.45 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.45 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.65 
 
 		 586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  38.02 
 
 		 617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.55 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  41.25 
 
 		 581 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  36.11 
 
 		 604 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.55 
 
 		 578 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.55 
 
 		 578 aa  343  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  41.34 
 
 		 468 aa  342  9e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2674  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.12 
 
 		 602 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0832532  normal  0.0804565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2802  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  36.59 
 
 		 601 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  40.96 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  36.3 
 
 		 603 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.69 
 
 		 583 aa  342  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.7 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.3 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1705  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.12 
 
 		 602 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.433379  normal  0.881057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1668  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.12 
 
 		 602 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.93 
 
 		 583 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1683  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.12 
 
 		 602 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 585 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.3 
 
 		 586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.3 
 
 		 586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  39.8 
 
 		 594 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  39.59 
 
 		 582 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  40.47 
 
 		 599 aa  340  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2584  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.55 
 
 		 600 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.544743  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 623 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.19 
 
 		 607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1557  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.71 
 
 		 602 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  38.35 
 
 		 579 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  37.09 
 
 		 586 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.09 
 
 		 586 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.41 
 
 		 594 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.45 
 
 		 586 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.17 
 
 		 588 aa  338  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  37.98 
 
 		 594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 575 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 586 aa  337  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.98 
 
 		 588 aa  337  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  38.46 
 
 		 615 aa  336  5.999999999999999e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  36.41 
 
 		 676 aa  336  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2388  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.34 
 
 		 600 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.496768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>