More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6317 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6317  fumarylacetoacetase  100 
 
 
390 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3806  fumarylacetoacetase  50.38 
 
 
415 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.020804  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2109  fumarylacetoacetase  49.1 
 
 
413 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0101993  normal  0.602779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2434  fumarylacetoacetase  48.61 
 
 
436 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0470374  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3411  fumarylacetoacetase  47.07 
 
 
427 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3924  fumarylacetoacetate hydrolase  48.23 
 
 
422 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3899  fumarylacetoacetate hydrolase  47.86 
 
 
436 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0719  fumarylacetoacetase  47.61 
 
 
434 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118527  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0790  fumarylacetoacetase  47.34 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3914  fumarylacetoacetate hydrolase  47.34 
 
 
434 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0781  fumarylacetoacetase  47.61 
 
 
436 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.477109  normal  0.394734 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1398  fumarylacetoacetase  48.62 
 
 
435 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312846  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0702  fumarylacetoacetase  47.59 
 
 
434 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0821  fumarylacetoacetase  47.34 
 
 
434 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.386558  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4535  fumarylacetoacetase  48.49 
 
 
423 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113775  normal  0.91176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3463  fumarylacetoacetase  48.49 
 
 
423 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.211156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0338  fumarylacetoacetase  47.09 
 
 
434 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09238  Fumarylacetoacetase  45.69 
 
 
427 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0394103  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2562  fumarylacetoacetase  51.27 
 
 
434 aa  362  8e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4375  fumarylacetoacetase  48 
 
 
420 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00028234  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2055  fumarylacetoacetase  48.37 
 
 
449 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1920  fumarylacetoacetase  48.37 
 
 
435 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.882274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2689  fumarylacetoacetase  48.37 
 
 
435 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0857  fumarylacetoacetase  48.37 
 
 
435 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.3577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3212  fumarylacetoacetase  48.62 
 
 
435 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3173  fumarylacetoacetase  48.12 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3227  fumarylacetoacetase  48.37 
 
 
886 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01759  fumarylacetoacetase  46.98 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0567  fumarylacetoacetate hydrolase  48.35 
 
 
424 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38530  fumarylacetoacetase  48.02 
 
 
432 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000507003  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0926  fumarylacetoacetase  45.06 
 
 
433 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.523606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3281  fumarylacetoacetase  48.02 
 
 
432 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948022  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1558  fumarylacetoacetase  45.48 
 
 
429 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0952524  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1038  fumarylacetoacetase  44.95 
 
 
429 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.318112  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5151  fumarylacetoacetase  45.32 
 
 
422 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.389186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1045  fumarylacetoacetase  47.76 
 
 
436 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4480  fumarylacetoacetase  47.03 
 
 
430 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0911  fumarylacetoacetate hydrolase  44.94 
 
 
434 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3550  fumarylacetoacetase  46.29 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.78252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50190  fumarylacetoacetase  48.34 
 
 
444 aa  339  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4620  fumarylacetoacetase  46.29 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0256  fumarylacetoacetate hydrolase  47.26 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4604  fumarylacetoacetase  46.29 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00921508  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1020  fumarylacetoacetase  45.06 
 
 
422 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.406627  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2533  fumarylacetoacetase  53.18 
 
 
436 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1192  fumarylacetoacetase  48.88 
 
 
435 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0909  fumarylacetoacetase  46.08 
 
 
422 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0287  fumarylacetoacetase  46.19 
 
 
424 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1109  fumarylacetoacetase  47.57 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.242132 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01896  Fumarylacetoacetase (FAA)(EC 3.7.1.2)(Fumarylacetoacetate hydrolase)(Beta-diketonase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00770]  44.83 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8847  Fumarylacetoacetase  48.84 
 
 
378 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.768181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4887  fumarylacetoacetase  44.94 
 
 
432 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3811  fumarylacetoacetase  48.3 
 
 
413 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.685186  normal  0.278222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1686  fumarylacetoacetase  47.57 
 
 
413 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3332  fumarylacetoacetase  48.03 
 
 
438 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0892  fumarylacetoacetase  45.18 
 
 
421 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0706  fumarylacetoacetase  46.92 
 
 
423 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0906967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2036  fumarylacetoacetase  44.9 
 
 
438 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94384  normal  0.503936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3789  fumarylacetoacetase  48.85 
 
 
398 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50281  predicted protein  45.31 
 
 
417 aa  323  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2724  fumarylacetoacetate hydrolase  45.01 
 
 
437 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.801091  normal  0.0910704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2044  fumarylacetoacetase  46.72 
 
 
431 aa  322  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0798972 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1118  fumarylacetoacetase  46.08 
 
 
424 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1685  fumarylacetoacetase  45.52 
 
 
429 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2735  fumarylacetoacetase  44.03 
 
 
429 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4256  fumarylacetoacetase  47.56 
 
 
398 aa  319  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0938214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07020  fumarylacetoacetate hydrolase  47.03 
 
 
394 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.257366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0818  fumarylacetoacetase  45.05 
 
 
430 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3325  fumarylacetoacetase  45.3 
 
 
431 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.736043  normal  0.102364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2622  fumarylacetoacetate hydrolase  43.08 
 
 
418 aa  318  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.817563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1081  fumarylacetoacetase  45.24 
 
 
420 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.075804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0432  fumarylacetoacetase  46.04 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6470  fumarylacetoacetase  45.38 
 
 
404 aa  312  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2007  fumarylacetoacetate hydrolase  46.17 
 
 
429 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79989  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4303  fumarylacetoacetase  46.43 
 
 
445 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0709  fumarylacetoacetase  44.42 
 
 
438 aa  311  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.981478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1916  fumarylacetoacetase  45.9 
 
 
397 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00439783  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10630  fumarylacetoacetate hydrolase  44.9 
 
 
412 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499579  normal  0.76587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2463  fumarylacetoacetate hydrolase  45.3 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1123  fumarylacetoacetase  42.97 
 
 
437 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3548  fumarylacetoacetase  41.49 
 
 
401 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.787467  normal  0.296952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1870  fumarylacetoacetase  45.06 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335153  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3863  fumarylacetoacetate hydrolase  44.55 
 
 
426 aa  302  6.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2996  fumarylacetoacetate hydrolase  44.1 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.273671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0655  fumarylacetoacetate hydrolase  45.24 
 
 
391 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4686  fumarylacetoacetase  45.5 
 
 
398 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.454046  normal  0.30172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2380  fumarylacetoacetase  43.17 
 
 
440 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0100  fumarylacetoacetase  42.86 
 
 
441 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1436  fumarylacetoacetate hydrolase  41.48 
 
 
416 aa  289  7e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.619546  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0995  fumarylacetoacetate hydrolase  41.43 
 
 
462 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1558  fumarylacetoacetase  42.39 
 
 
431 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.492356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0529  fumarylacetoacetase  46.45 
 
 
401 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7461  fumarylacetoacetate hydrolase  41.43 
 
 
440 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.239921  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2528  fumarylacetoacetate hydrolase  41.12 
 
 
450 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.172477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0412  fumarylacetoacetase  43.1 
 
 
441 aa  278  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784977  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1794  fumarylacetoacetate hydrolase  42.75 
 
 
436 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5612  fumarylacetoacetase  40.66 
 
 
440 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250904  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5976  fumarylacetoacetase  40.66 
 
 
440 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000358245  decreased coverage  0.000159634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0090  Fumarylacetoacetase  43.67 
 
 
394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18890  fumarylacetoacetate hydrolase  40.61 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0251227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>