More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6222 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  46.33 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0803  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 196 aa  98.6  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 204 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5659  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0433662  hitchhiker  0.00993278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 216 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 219 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  31.67 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 207 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  31.36 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  29.82 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  85.5  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 191 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 201 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 206 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 207 aa  84.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  30.34 
 
 		 216 aa  84.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 215 aa  84.3  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4955  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00123858  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_2510  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_2299  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.633617  normal  0.029766 
 
 
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