277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6218 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  100 
 
 		 311 aa  627  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  69.58 
 
 		 309 aa  417  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  61.69 
 
 		 309 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  53.42 
 
 		 311 aa  339  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  52.65 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  52.34 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  50.78 
 
 		 320 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  52.96 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  51.56 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  50.81 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  51.56 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  53.09 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  50.96 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  46.71 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  39.03 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  41.64 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  41.64 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  38.68 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  35.93 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  35.93 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  35.93 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  42.43 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  36.08 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  36.18 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  35.74 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  36.18 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  35.62 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  39.63 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  32.28 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  33.64 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  34.95 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  34.81 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  34.81 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  34.81 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  34.81 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  33.23 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  38 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  34.71 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  33.01 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  32.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  32.69 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  36.33 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  35.45 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  42.81 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  36.59 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  35.34 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  36.24 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  32.7 
 
 		 318 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  35.87 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  34.3 
 
 		 315 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  35.51 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  35.14 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  35.02 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  34.32 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  35.54 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  33.99 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  33.67 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  37.87 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  32.3 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  33.33 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  32.77 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  31.83 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  31.83 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  34.23 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  32.25 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  32.05 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  31.29 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  32.42 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  32.13 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  34.81 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  30.23 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  30.35 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  30.87 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  30.5 
 
 		 321 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  32.9 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  30.55 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  30.5 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  30.82 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  31.55 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  32.53 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  31.31 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  30 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  30 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0376  homoserine kinase  34.56 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  31.31 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  30.25 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  36.08 
 
 		 326 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  30.7 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  29.87 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  29.52 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  31.19 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  29.87 
 
 		 320 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1960  homoserine kinase  32.71 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000160344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  32.79 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>