82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6189 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6189  transcriptional repressor, CopY family  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3380  transcriptional repressor, CopY family  71.31 
 
 		 124 aa  193  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0214  Penicillinase repressor  58.54 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.156446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0782  transcriptional repressor, CopY family  52.03 
 
 		 124 aa  151  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130795  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07976  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  44.63 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6520  transcriptional repressor, CopY family  44.26 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.818398  normal  0.183506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5968  transcriptional repressor, CopY family  48.28 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.930871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3753  transcriptional repressor, CopY family  45.22 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3211  CopY family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2772  CopY family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00766879  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2770  CopY family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.23877  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07470  transcriptional regulator  50 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.717379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1362  CopY family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07786  putative antibiotic resistance-related regulatory protein  37.39 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3429  transcriptional repressor, CopY family  36.52 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5136  transcriptional repressor, CopY family  38.98 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110862  normal  0.0983115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1835  transcriptional repressor, CopY family  38.46 
 
 		 118 aa  90.5  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1287  transcriptional repressor, CopY family  36.97 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.58486  normal  0.221741 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  36.36 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0075  hypothetical protein  33.98 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0391705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3133  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0957082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2422  CopY family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0381488  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1403  hypothetical protein  29.6 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1590  hypothetical protein  29.84 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3788  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00024943  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0578  penicillinase repressor  33.05 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  33.65 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3208  CopY family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.448139  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2033  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1078  penicillinase repressor  30.71 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1006  penicillinase repressor  30.71 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3882  CopY family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0821415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00935  transcriptional regulator, BlaI family protein  28.45 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  27.97 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  31.86 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1110  penicillinase repressor  28.91 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0993  beta-lactamase (penicillinase) repressor  29.13 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3352  transcriptional repressor, CopY family  26.45 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1175  penicillinase repressor  28.91 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2407  penicillinase repressor  26.23 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3737  CopY family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.185846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1141  Penicillinase repressor  29.66 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2877  transcriptional repressor, CopY family  25.41 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2616  transcriptional repressor, CopY family  26.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3341  CopY family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2641  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0464026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2588  transcriptional repressor, CopY family  29.57 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1811  CopY family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  32.77 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2928  CopY family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.315918  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2616  CopY family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.940233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2027  transcriptional repressor, CopY family  27.12 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129536  normal  0.867039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  32.95 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0210  CopY family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  32.95 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3721  transcriptional repressor, CopY family  30.09 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5182  transcriptional repressor, CopY family  31.09 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717917  hitchhiker  0.0058899 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  33.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6204  transcriptional repressor, CopY family  30.09 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.783598  normal  0.478416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  26.61 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  29.51 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2519  methicillin-resistance regulatory protein MecI  23.08 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0200801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0031  penicillinase repressor  23.08 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0031  CopY family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1354  transcriptional repressor, CopY family  29.7 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  31.9 
 
 		 118 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3585  transcriptional repressor, CopY family protein  25.2 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0948  CopY family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 142 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000394556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  25.2 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  27.59 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 139 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1459  penicillinase repressor  21.74 
 
 		 126 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000472068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0287  transcriptional repressor, CopY family  30.25 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0384  transcriptional repressor CopY  39.44 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0628  copper transport repressor, CopY/TcrY family  24.79 
 
 		 161 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.922307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>