48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6176 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  44.62 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  52.31 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  47.69 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  42.65 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  43.48 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  43.48 
 
 		 65 aa  50.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  40.85 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  35.14 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  40.58 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  41.27 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  44.62 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  41.79 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  41.54 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1025  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  39.71 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1022  hypothetical protein  43.28 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.493994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1250  hypothetical protein  46.15 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  37.68 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  38.81 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  33.82 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  31.88 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  37.31 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  39.68 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  39.13 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  37.68 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  37.1 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  39.39 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  38.24 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  37.1 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  40.58 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  34.38 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  39.06 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  36.36 
 
 		 64 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  32.88 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1189  hypothetical protein  38.71 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  39.06 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0448  hypothetical protein  35.19 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000908926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  40.32 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0723  hypothetical protein  30.3 
 
 		 104 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  38.81 
 
 		 62 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>