More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6150 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 381 aa  774    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  42.82 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  27.91 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 371 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  33.55 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  24.74 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.53 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2407  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.411749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  23.41 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.03 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  24.21 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  35 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1287  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  34.82 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  21.52 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  36.44 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2170  helix-turn-helix, AraC type  30.51 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2262  transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0664  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2584  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 357 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 370 aa  67  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0426  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0607795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.11 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.05 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3336  AraC family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  25.98 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3712  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  25.95 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  32.71 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0135  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  32.63 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 1201 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 791 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3028  response regulator receiver protein  24.59 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.360206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 		 791 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 285 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 259 aa  54.3  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  29.06 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 292 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 304 aa  53.9  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  28.93 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 745 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 745 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 292 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 336 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0632  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0334632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>