143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6103 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 454 aa  934    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  43.47 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  35.53 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  38.74 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  34.18 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  34.18 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  34.35 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  32.58 
 
 		 442 aa  216  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  32.2 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  32.97 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  32.44 
 
 		 463 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  32.06 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  31.77 
 
 		 495 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  32.69 
 
 		 469 aa  203  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  35.62 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  32.07 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  29.11 
 
 		 482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  29.12 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  30.89 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  30.32 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  29.03 
 
 		 490 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.82 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  28.87 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  28.01 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  28.34 
 
 		 509 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  25.5 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  26.35 
 
 		 479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  26.68 
 
 		 460 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  25.8 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  25.27 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 473 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  26.13 
 
 		 474 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  24.47 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 		 473 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  25.28 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.45 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  26.72 
 
 		 488 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  29.22 
 
 		 473 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  22.01 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  22.2 
 
 		 466 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  23.03 
 
 		 466 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  24.43 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  21.37 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  21.37 
 
 		 463 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  28.01 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  20.94 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  21.32 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  24.27 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  26.54 
 
 		 475 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  22.98 
 
 		 482 aa  99.8  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  25.27 
 
 		 477 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  26.42 
 
 		 589 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  26.51 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  25.75 
 
 		 469 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  23.46 
 
 		 553 aa  85.1  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  26.96 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.06 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  24.58 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.76 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.29 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  23.91 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  27.29 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  25.17 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  21.31 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  25.63 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  24.09 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  21.95 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  22.62 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  24.44 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  26.25 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  24.78 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  23.13 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1971  amine oxidase  25 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2362  amine oxidase  24.2 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  30.28 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1449  amine oxidase  25.08 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  21.27 
 
 		 399 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>