More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6052 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  100 
 
 
453 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  38.85 
 
 
457 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  38.72 
 
 
482 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.03 
 
 
500 aa  249  9e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  37.22 
 
 
495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  34.25 
 
 
470 aa  243  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  38 
 
 
486 aa  243  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.81 
 
 
472 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  34.04 
 
 
466 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  34.73 
 
 
452 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  36.38 
 
 
479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  34.3 
 
 
474 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  35.42 
 
 
438 aa  230  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  32.29 
 
 
539 aa  229  5e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  36.77 
 
 
491 aa  229  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  36.49 
 
 
453 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  35.13 
 
 
467 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  34.04 
 
 
487 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  33.27 
 
 
523 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.97 
 
 
517 aa  224  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.11 
 
 
497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  34 
 
 
486 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.74 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  33.26 
 
 
481 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  34.82 
 
 
470 aa  219  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  32.15 
 
 
465 aa  219  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  35.1 
 
 
442 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  34 
 
 
457 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  32.2 
 
 
542 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  34.75 
 
 
491 aa  216  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.07 
 
 
480 aa  216  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  36.49 
 
 
457 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  32.28 
 
 
471 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  35.36 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  33.18 
 
 
519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.48 
 
 
553 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  35.75 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.16 
 
 
631 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  33.4 
 
 
482 aa  213  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  30.82 
 
 
500 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.39 
 
 
484 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.92 
 
 
533 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  32.44 
 
 
468 aa  209  8e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  33.04 
 
 
506 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.96 
 
 
553 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  33.48 
 
 
501 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.34 
 
 
543 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  31.19 
 
 
480 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  32.95 
 
 
440 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  31.56 
 
 
548 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  32.35 
 
 
500 aa  202  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  30.63 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  32.13 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.49 
 
 
488 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  34.1 
 
 
471 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.72 
 
 
510 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  30.31 
 
 
627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  30.83 
 
 
523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.97 
 
 
490 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  31.29 
 
 
517 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.85 
 
 
543 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.08 
 
 
492 aa  194  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  31.97 
 
 
462 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.52 
 
 
536 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.2 
 
 
551 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.24 
 
 
497 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.46 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.76 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  31.3 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.46 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.76 
 
 
497 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  30.69 
 
 
724 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.43 
 
 
513 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  32.29 
 
 
637 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.84 
 
 
551 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  32.84 
 
 
478 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.52 
 
 
584 aa  186  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.85 
 
 
497 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  30.21 
 
 
522 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  33.19 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  31.1 
 
 
481 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  29.7 
 
 
520 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  30.5 
 
 
497 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  27.73 
 
 
578 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  28.19 
 
 
571 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  27.44 
 
 
563 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  31 
 
 
480 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.12 
 
 
559 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.65 
 
 
582 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  33.87 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  29.36 
 
 
510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  31.37 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  30.84 
 
 
564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  29.2 
 
 
554 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  31.58 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  30.59 
 
 
489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  29.57 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  27.65 
 
 
541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.21 
 
 
638 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  26.36 
 
 
609 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>