40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6022 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 195 aa  404  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.72 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.95 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.15 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  42.05 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.65 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  40 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.61 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  28.72 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.89 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.1 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  25.38 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.79 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.55 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  27.92 
 
 		 545 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  23.32 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  26.34 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  25.37 
 
 		 558 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.7 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  28.08 
 
 		 570 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  22.39 
 
 		 550 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.98 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.41 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.04 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  23 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  22.06 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.57 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  27.04 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  22.4 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.74 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  24.64 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.26 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  20.86 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 1019 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  20.86 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0438  hypothetical protein  25.59 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.503828  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.84 
 
 		 218 aa  42  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  26.53 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>