More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5985 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  100 
 
 
453 aa  917    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  43.41 
 
 
431 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  41.06 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  39.58 
 
 
464 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  42.82 
 
 
431 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  40.86 
 
 
438 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 
419 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  37.62 
 
 
421 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  46.4 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.17 
 
 
430 aa  231  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.46 
 
 
455 aa  210  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.46 
 
 
455 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
477 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  35.08 
 
 
448 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  31.21 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  29.37 
 
 
454 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  31.86 
 
 
441 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.33 
 
 
420 aa  192  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  32.62 
 
 
423 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.22 
 
 
429 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.95 
 
 
421 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  32.18 
 
 
421 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.83 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.95 
 
 
468 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 
464 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  32.12 
 
 
470 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.84 
 
 
425 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  32.05 
 
 
447 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.02 
 
 
464 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  29.93 
 
 
424 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.19 
 
 
442 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  28.84 
 
 
442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  28.27 
 
 
433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  28.64 
 
 
464 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  32.55 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  28.88 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  32.57 
 
 
434 aa  182  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.7 
 
 
424 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  33.65 
 
 
439 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  37.69 
 
 
287 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  32.79 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  37.69 
 
 
287 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.8 
 
 
424 aa  179  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  32.63 
 
 
435 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
464 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  28.4 
 
 
417 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 
430 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.56 
 
 
447 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  30.55 
 
 
434 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  29.34 
 
 
434 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.34 
 
 
414 aa  176  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  28.07 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  28.04 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  32.07 
 
 
440 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  29.86 
 
 
436 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  30.66 
 
 
435 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  31.25 
 
 
426 aa  169  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  31.33 
 
 
443 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  29.56 
 
 
432 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  29.02 
 
 
465 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
446 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.01 
 
 
425 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 
436 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.46 
 
 
421 aa  168  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.22 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  26.92 
 
 
467 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  30.34 
 
 
479 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  31.64 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.36 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  40.66 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  40.66 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  30.51 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.05 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  28.86 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  39.83 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.8 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 
291 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  30.09 
 
 
429 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  35.29 
 
 
431 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  28.54 
 
 
424 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  30.07 
 
 
438 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.69 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  30.77 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  28.3 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 
291 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  28.3 
 
 
429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  27.16 
 
 
429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  30.27 
 
 
523 aa  163  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.9 
 
 
291 aa  163  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.6 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  30.05 
 
 
420 aa  162  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  29.15 
 
 
427 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  39.11 
 
 
291 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  39.11 
 
 
291 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>