More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5979 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 520 aa  1065    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  58.22 
 
 		 516 aa  639    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  62.98 
 
 		 535 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  77.52 
 
 		 520 aa  851    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  54.84 
 
 		 516 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  51.07 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  50.29 
 
 		 543 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  49.71 
 
 		 516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  50.58 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  47.41 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  38.13 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  37.02 
 
 		 562 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  36.94 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  39.33 
 
 		 551 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  36.91 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  41.81 
 
 		 570 aa  315  9e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  41.56 
 
 		 570 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  40.92 
 
 		 604 aa  300  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  32.63 
 
 		 525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  36.12 
 
 		 515 aa  283  8.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.78 
 
 		 503 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.05 
 
 		 496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  34.93 
 
 		 494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  37.05 
 
 		 496 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  34.71 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  34.75 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  35.76 
 
 		 503 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  34.39 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  35.46 
 
 		 866 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  32.32 
 
 		 636 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  34.99 
 
 		 741 aa  259  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  33.26 
 
 		 489 aa  259  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.08 
 
 		 499 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  33.18 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.38 
 
 		 531 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  33.18 
 
 		 489 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  30.27 
 
 		 512 aa  257  3e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  34.08 
 
 		 543 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  32.57 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  30.78 
 
 		 537 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  31.73 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  34.84 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  36.61 
 
 		 500 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.79 
 
 		 483 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  36.4 
 
 		 926 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  34.3 
 
 		 497 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  34.72 
 
 		 491 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  34.26 
 
 		 908 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  34.71 
 
 		 702 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  31.49 
 
 		 562 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  35.32 
 
 		 1015 aa  243  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3349  ribonuclease, Rne/Rng family  35.71 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.86 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  33.94 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  32.28 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  33.56 
 
 		 792 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  35 
 
 		 1194 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 990 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  31.03 
 
 		 1022 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0457  ribonuclease, Rne/Rng family  33.81 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  34.97 
 
 		 713 aa  240  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  31.07 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  31.07 
 
 		 496 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  34.51 
 
 		 1427 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  33.72 
 
 		 606 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  33.49 
 
 		 602 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  36.75 
 
 		 507 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  32.48 
 
 		 411 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  33.95 
 
 		 1123 aa  239  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  34.52 
 
 		 806 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0791  ribonuclease, Rne/Rng family  35.56 
 
 		 1076 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127773  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  31.81 
 
 		 942 aa  239  9e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1207  ribonuclease E  34.55 
 
 		 1061 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738621  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  33.81 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1463  ribonuclease E  34.55 
 
 		 1061 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00215249  hitchhiker  0.000000103406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2516  ribonuclease E  34.55 
 
 		 1061 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000196842  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01080  fused ribonucleaseE: endoribonuclease/RNA-binding protein/RNA degradosome binding protein  34.55 
 
 		 1061 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00444981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2562  ribonuclease, Rne/Rng family  34.55 
 
 		 1061 aa  238  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000807422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  34.25 
 
 		 688 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  34.52 
 
 		 903 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01088  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1061 aa  237  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00236445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1207  ribonuclease E  34.55 
 
 		 1061 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2042  ribonuclease E  34.78 
 
 		 1057 aa  238  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000184616  hitchhiker  0.00765925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2843  ribonuclease E and G  33.33 
 
 		 764 aa  237  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  34.43 
 
 		 919 aa  237  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2511  ribonuclease E  34.86 
 
 		 1113 aa  237  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00474333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  33.64 
 
 		 571 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  34.25 
 
 		 1012 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  31.94 
 
 		 1141 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1297  ribonuclease E  34.32 
 
 		 1067 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148033 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2241  ribonuclease E  34.55 
 
 		 1061 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000115068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2003  ribonuclease E  34.32 
 
 		 1067 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000122213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2187  ribonuclease E  34.32 
 
 		 1068 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.33181  hitchhiker  0.00000000773492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1600  ribonuclease E  34.78 
 
 		 1048 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000427165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1282  ribonuclease E  34.32 
 
 		 1068 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783205  hitchhiker  0.0000048225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1253  ribonuclease E  34.32 
 
 		 1067 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  33.41 
 
 		 474 aa  236  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  32.18 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  33.64 
 
 		 687 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  34.05 
 
 		 1265 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>