More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5964 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5964  phosphoribosylamine/glycine ligase  100 
 
 		 428 aa  868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.262465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3601  phosphoribosylamine--glycine ligase  70.4 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0296  phosphoribosylamine--glycine ligase  62.35 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0919  phosphoribosylamine--glycine ligase  59.34 
 
 		 423 aa  518  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.42013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1041  phosphoribosylamine--glycine ligase  55.42 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0267  phosphoribosylamine--glycine ligase  58.25 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1360  phosphoribosylamine--glycine ligase  57.61 
 
 		 431 aa  488  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02975  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.1 
 
 		 427 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0569996  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0195  phosphoribosylamine--glycine ligase  56.47 
 
 		 425 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.58 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 429 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.95 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3862  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.48 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.256361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  47.67 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.37 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.67 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.67 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  47.67 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.67 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  47.56 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.21 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.56 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.41 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.79 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.55 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.36 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.62 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.25 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.74 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.15 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.13 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.44 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  44.94 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.42 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.85 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 430 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.55 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.59 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.16 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.69 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.86 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0805  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.09 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.65 
 
 		 428 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.92 
 
 		 428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1753  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.528627  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0434  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.41 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.77 
 
 		 430 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0177  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.73 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4104  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 427 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.84 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  44.84 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0221  phosphoribosylamine/glycine ligase  43.97 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.98 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03941  Phosphoribosylamine-glycine ligase  45.99 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.24 
 
 		 431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 429 aa  355  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.71 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0036  phosphoribosylamine/glycine ligase  45.28 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.05 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.2 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.73 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  43.39 
 
 		 809 aa  353  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  42.79 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.26 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1699  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.36 
 
 		 427 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251383  normal  0.989876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.85 
 
 		 422 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.66 
 
 		 426 aa  352  8e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.97 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 432 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.95 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.08 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.58 
 
 		 423 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1442  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.37 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.47 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3406  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.83 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.81 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.49 
 
 		 422 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.63 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.9 
 
 		 419 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3668  phosphoribosylamine--glycine ligase  44.84 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  43.6 
 
 		 432 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>